More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0676 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
396 aa  809    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 
374 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  34.89 
 
 
401 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 
366 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
364 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
374 aa  152  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  37.02 
 
 
375 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
374 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 
396 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 
382 aa  113  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  45.1 
 
 
379 aa  113  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  35.13 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 
381 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 
397 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 
358 aa  106  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  34.77 
 
 
393 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 
378 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  32.59 
 
 
390 aa  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
359 aa  100  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 
386 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 
379 aa  97.4  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
415 aa  96.7  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.76 
 
 
388 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  27.03 
 
 
384 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  38.67 
 
 
375 aa  94.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  29.62 
 
 
411 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
379 aa  94  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  39.76 
 
 
381 aa  94  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  27.67 
 
 
396 aa  93.6  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 
379 aa  92.8  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
410 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
390 aa  90.9  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
414 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
383 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  25.94 
 
 
394 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
350 aa  89.7  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
419 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 
408 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
384 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  27 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
382 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  30 
 
 
935 aa  89  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  27.03 
 
 
406 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
387 aa  89  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  31.1 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25.66 
 
 
401 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 
379 aa  87.4  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
428 aa  87  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
373 aa  87  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
390 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  25.98 
 
 
416 aa  86.7  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
379 aa  86.3  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  38.41 
 
 
381 aa  86.3  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
790 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  27.75 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  25.51 
 
 
404 aa  84.7  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  27.5 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2749  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000830011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
414 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
406 aa  84  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
413 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
414 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
365 aa  83.6  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
360 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
439 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
439 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3362  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
433 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  25 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 
377 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
353 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1660  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
435 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.208349  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1691  glycogen synthase  28.05 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533865  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.64 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
438 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>