More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0241 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  100 
 
 		 384 aa  784    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  48.68 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 		 378 aa  196  6e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  32.01 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 		 374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 		 381 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 386 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 377 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  27.79 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  27.19 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 382 aa  110  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 		 666 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  26.93 
 
 		 358 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  30.29 
 
 		 364 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  23.7 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4124  glycosyl transferase, group 1  35.59 
 
 		 349 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 366 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 		 372 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 		 381 aa  94  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  23.99 
 
 		 397 aa  92.8  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  23.16 
 
 		 364 aa  90.9  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 		 392 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  23.8 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  27.59 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 		 789 aa  77  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 790 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4250  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142252  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  25.18 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  28.08 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  27.94 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  28.57 
 
 		 443 aa  69.7  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 		 426 aa  69.7  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 388 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.72 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 		 761 aa  67.4  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 419 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 		 359 aa  67  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2185  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1188  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  30.65 
 
 		 417 aa  66.2  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  23.02 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  25 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 		 767 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 		 763 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3087  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5077  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5783  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4395  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>