More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0255 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 358 aa  723    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  51.12 
 
 		 382 aa  348  6e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  50.68 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  46.61 
 
 		 375 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  43.87 
 
 		 379 aa  302  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  50.56 
 
 		 374 aa  301  8.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  42.02 
 
 		 381 aa  255  8e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  37.38 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 		 375 aa  182  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 378 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 374 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 386 aa  146  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  35.73 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  33.53 
 
 		 364 aa  126  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  27.76 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  34.77 
 
 		 358 aa  119  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  32.85 
 
 		 357 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 		 397 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 		 396 aa  106  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 		 364 aa  99.8  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  50.41 
 
 		 405 aa  99.4  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 		 666 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 		 374 aa  92.8  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 388 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0955  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 364 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4250  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142252  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  27.42 
 
 		 797 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  29.48 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 789 aa  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  38.97 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 		 774 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 763 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.9 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 747 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 759 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  31.12 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  23.62 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  22.69 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  28.16 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  36.23 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.2 
 
 		 401 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 871 aa  66.2  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 790 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 780 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2521  putative glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329961  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  30.06 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 761 aa  63.9  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 767 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 660 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 		 765 aa  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  37.4 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.93 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  25.82 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  31.34 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>