More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1060 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  48.56 
 
 		 790 aa  743    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 789 aa  1622    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  50.4 
 
 		 774 aa  750    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  70.18 
 
 		 761 aa  1055    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  51.01 
 
 		 765 aa  739    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  47.55 
 
 		 767 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  44.85 
 
 		 763 aa  659    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  57.14 
 
 		 759 aa  880    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  42.23 
 
 		 780 aa  620  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  41.82 
 
 		 823 aa  547  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  38.26 
 
 		 747 aa  539  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  36.35 
 
 		 797 aa  533  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  37.58 
 
 		 759 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 		 774 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 762 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 		 756 aa  364  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  40.38 
 
 		 386 aa  320  9e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 		 411 aa  303  8.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  39.04 
 
 		 391 aa  299  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  38.73 
 
 		 397 aa  286  8e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  37.23 
 
 		 391 aa  283  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  35.97 
 
 		 390 aa  271  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  37.11 
 
 		 395 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  39.15 
 
 		 405 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 399 aa  220  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 		 416 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  35.95 
 
 		 393 aa  207  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  34.62 
 
 		 337 aa  204  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  33.72 
 
 		 353 aa  204  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 		 388 aa  202  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  36.46 
 
 		 371 aa  200  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  32.07 
 
 		 360 aa  200  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  31.64 
 
 		 349 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  34.1 
 
 		 364 aa  196  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  35.01 
 
 		 378 aa  189  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 		 414 aa  187  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 		 392 aa  183  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 		 405 aa  182  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 399 aa  180  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  34.78 
 
 		 371 aa  174  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 		 393 aa  172  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  31.59 
 
 		 393 aa  170  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  31.59 
 
 		 393 aa  170  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  34.17 
 
 		 404 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  32.49 
 
 		 378 aa  157  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  36.36 
 
 		 338 aa  153  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  33.14 
 
 		 340 aa  144  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  31.67 
 
 		 348 aa  140  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  33.53 
 
 		 340 aa  140  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  30.82 
 
 		 339 aa  137  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  34 
 
 		 367 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  36.63 
 
 		 351 aa  124  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 		 388 aa  90.1  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 		 375 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  22.87 
 
 		 384 aa  77.4  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 		 374 aa  77  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3542  hypothetical protein  23.26 
 
 		 357 aa  77.4  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000965679  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 		 384 aa  76.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  20.65 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 		 536 aa  74.3  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  25.27 
 
 		 395 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 		 413 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 		 1233 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  24.91 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  21.89 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 		 381 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  21.91 
 
 		 351 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  27.43 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 		 672 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  27.27 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 748 aa  68.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  26.77 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  21.72 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  30.8 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  29.17 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3305  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 		 392 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0317499  normal  0.753589 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.38 
 
 		 385 aa  66.2  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4609  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 		 416 aa  66.6  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.955462  normal  0.431404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  23.27 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 770 aa  65.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.51 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  23.18 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.6 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  29.56 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  25.33 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>