More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1240 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
395 aa  811    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  76.55 
 
 
405 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  55.42 
 
 
397 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  39.39 
 
 
759 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  38.4 
 
 
386 aa  296  5e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  42.02 
 
 
761 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  39.9 
 
 
774 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  38.62 
 
 
797 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  37.69 
 
 
411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  36.69 
 
 
391 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  38.04 
 
 
790 aa  278  9e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 
391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
747 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  40.05 
 
 
765 aa  270  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  37.11 
 
 
789 aa  268  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  34.93 
 
 
390 aa  262  8e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  36.44 
 
 
763 aa  259  7e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  35.9 
 
 
759 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  37.91 
 
 
823 aa  256  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  37.07 
 
 
780 aa  246  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
767 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 
399 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
416 aa  222  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  35.32 
 
 
774 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
756 aa  218  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  36.91 
 
 
762 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 
388 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
378 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
414 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
393 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 
371 aa  176  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
405 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
392 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 
393 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 
393 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 
393 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
1233 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  25.46 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  25.18 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  24.94 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
396 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 
374 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3305  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0317499  normal  0.753589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 
382 aa  67  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  23.99 
 
 
375 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
358 aa  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
350 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  25.78 
 
 
384 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0070  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
391 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0307199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
366 aa  64.7  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
406 aa  64.3  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  25.9 
 
 
392 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
381 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 
379 aa  63.9  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
381 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
378 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0710  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.93 
 
 
444 aa  63.2  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
519 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
383 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2179  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
388 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.416488  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1288  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
385 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.376633 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
396 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 
374 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
393 aa  60.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
389 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  26.51 
 
 
383 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
399 aa  59.7  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
372 aa  59.7  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  25.46 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 
371 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 
348 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0611  glycosyl transferase, family 1  23.33 
 
 
440 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  22.8 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
390 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0885  a-glycosyltransferase  22.08 
 
 
384 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00174495  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
414 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  21.57 
 
 
360 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 
389 aa  57  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.45 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 
388 aa  56.2  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1785  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 
380 aa  56.2  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
378 aa  56.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  27.91 
 
 
417 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  25.54 
 
 
935 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
417 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1589  glycosyltransferase  24.56 
 
 
393 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.679679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
399 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
375 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
375 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>