More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2506 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  63.76 
 
 		 762 aa  902    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 774 aa  1551    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  37.09 
 
 		 774 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 		 790 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 		 763 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 		 759 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  34.89 
 
 		 789 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 		 747 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  34.94 
 
 		 761 aa  382  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 		 780 aa  379  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 		 765 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  33.12 
 
 		 759 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  35.45 
 
 		 823 aa  368  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  30.06 
 
 		 797 aa  357  5.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  47.99 
 
 		 416 aa  357  5.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  36.27 
 
 		 767 aa  355  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 		 756 aa  297  5e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  47.33 
 
 		 348 aa  287  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  40.37 
 
 		 386 aa  280  9e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  35.44 
 
 		 411 aa  264  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  35.13 
 
 		 391 aa  258  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  34.29 
 
 		 390 aa  243  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  35.17 
 
 		 391 aa  233  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 		 405 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 		 395 aa  228  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 		 397 aa  212  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 		 399 aa  205  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  35.13 
 
 		 371 aa  204  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 		 414 aa  193  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  32.38 
 
 		 392 aa  187  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  34.24 
 
 		 399 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 		 393 aa  181  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 388 aa  180  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 		 405 aa  179  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 		 378 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  32.34 
 
 		 360 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 393 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 393 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 393 aa  161  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  27.7 
 
 		 349 aa  147  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  30.39 
 
 		 353 aa  145  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  28.57 
 
 		 337 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  32.35 
 
 		 371 aa  124  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  34.63 
 
 		 340 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  28.02 
 
 		 364 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  32.12 
 
 		 340 aa  110  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  30.16 
 
 		 378 aa  110  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  32.52 
 
 		 338 aa  107  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  27.65 
 
 		 339 aa  107  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  31.88 
 
 		 367 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 1233 aa  98.2  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  32.41 
 
 		 351 aa  95.9  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  27.84 
 
 		 404 aa  94.7  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 		 394 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  25.36 
 
 		 1635 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 		 397 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.55 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.66 
 
 		 404 aa  73.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.61 
 
 		 372 aa  73.2  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 421 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1692  glycosyl transferase, group 1  25.74 
 
 		 375 aa  72  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 381 aa  72  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 		 404 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 		 401 aa  69.7  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3542  hypothetical protein  22.34 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000965679  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 374 aa  67  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 		 433 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  32.97 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 366 aa  63.9  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 		 415 aa  63.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  16.3 
 
 		 1232 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 378 aa  62  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  22.3 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 		 422 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  27.45 
 
 		 364 aa  60.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 		 367 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  23.9 
 
 		 374 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 360 aa  60.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  22.84 
 
 		 348 aa  60.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  27.12 
 
 		 420 aa  60.1  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  27.22 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>