More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4294 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  93.03 
 
 		 405 aa  758    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 405 aa  825    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  75.98 
 
 		 411 aa  553  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  63.8 
 
 		 417 aa  531  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  46.67 
 
 		 409 aa  322  8e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  45.15 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  42.93 
 
 		 397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  44.22 
 
 		 394 aa  307  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  42.36 
 
 		 394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  43 
 
 		 393 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.72 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  42.53 
 
 		 397 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  24.32 
 
 		 394 aa  99.8  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 		 392 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 386 aa  94  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 445 aa  92.8  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  28.13 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  28.46 
 
 		 404 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 		 419 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  28.04 
 
 		 723 aa  90.1  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  23.42 
 
 		 416 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 		 481 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  22.96 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6558  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  25.85 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  23.75 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4413  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4476  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  21.05 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 		 436 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  26.27 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2399  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 		 996 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.969384  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3221  glycosyl transferase, group 1  22.28 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0404695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 		 392 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  26.29 
 
 		 569 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.94 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  27.59 
 
 		 557 aa  73.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  24.57 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  21.99 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  25.07 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  22.83 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  19.73 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  23.8 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3634  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.53 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>