38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1917 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  706    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  36.28 
 
 
360 aa  219  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  35.38 
 
 
337 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  33.33 
 
 
353 aa  206  6e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  34.52 
 
 
349 aa  192  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 
756 aa  179  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
759 aa  175  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
747 aa  172  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  34.96 
 
 
774 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  32.62 
 
 
364 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  29.18 
 
 
797 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
790 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  33.03 
 
 
759 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
780 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
763 aa  150  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  31.22 
 
 
378 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
765 aa  139  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
767 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  28.29 
 
 
371 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  26.24 
 
 
404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  29.48 
 
 
348 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
789 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
823 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
762 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
774 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  25.53 
 
 
340 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
761 aa  99.4  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  25.45 
 
 
340 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  28.96 
 
 
338 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  25.16 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  25.15 
 
 
367 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0361  hypothetical protein  21.93 
 
 
480 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1200  hypothetical protein  24.92 
 
 
348 aa  52.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3542  hypothetical protein  21.83 
 
 
357 aa  49.3  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000965679  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1533  hypothetical protein  25.34 
 
 
424 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1730  hypothetical protein  25.34 
 
 
424 aa  43.9  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064452 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1640  hypothetical protein  25.34 
 
 
424 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3891  hypothetical protein  36.23 
 
 
703 aa  43.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>