22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1640 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1533  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  877    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1640  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  877    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1730  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  877    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000064452 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0361  hypothetical protein  35.35 
 
 		 480 aa  227  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0944  hypothetical protein  28.78 
 
 		 718 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3891  hypothetical protein  27.5 
 
 		 703 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2270  hypothetical protein  24.93 
 
 		 672 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.417256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1200  hypothetical protein  24.72 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 		 747 aa  63.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 		 759 aa  60.1  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 		 780 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  25.07 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 774 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  30.7 
 
 		 340 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 763 aa  47.4  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 762 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 		 756 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  31.82 
 
 		 364 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  25.34 
 
 		 339 aa  43.9  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  31.71 
 
 		 353 aa  43.1  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  37.88 
 
 		 774 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  23.58 
 
 		 351 aa  43.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>