17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2270 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2270  hypothetical protein  100 
 
 
672 aa  1302    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.417256  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3891  hypothetical protein  50.67 
 
 
703 aa  602  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0361  hypothetical protein  34.94 
 
 
480 aa  159  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1533  hypothetical protein  24.93 
 
 
424 aa  111  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1730  hypothetical protein  24.93 
 
 
424 aa  111  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064452 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1640  hypothetical protein  24.93 
 
 
424 aa  111  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1200  hypothetical protein  25.45 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0944  hypothetical protein  21.68 
 
 
718 aa  75.1  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
780 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
774 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  42.42 
 
 
360 aa  52.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
790 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  55.81 
 
 
340 aa  47.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  57.14 
 
 
351 aa  47.4  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
756 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  55.81 
 
 
340 aa  45.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  48.89 
 
 
338 aa  43.9  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>