More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1162 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  48.04 
 
 		 761 aa  687    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  52.75 
 
 		 774 aa  830    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  48.56 
 
 		 789 aa  723    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 790 aa  1652    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  53.72 
 
 		 765 aa  832    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  46.5 
 
 		 780 aa  699    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  45.91 
 
 		 763 aa  694    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  47.16 
 
 		 759 aa  676    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  42.47 
 
 		 767 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  41.47 
 
 		 759 aa  571  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  41.43 
 
 		 747 aa  567  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  39.53 
 
 		 823 aa  529  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  37.06 
 
 		 797 aa  522  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 		 774 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 		 756 aa  401  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 		 762 aa  402  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  41.9 
 
 		 386 aa  334  4e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  41.82 
 
 		 411 aa  331  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  42.12 
 
 		 391 aa  330  8e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  38.42 
 
 		 391 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  39.1 
 
 		 405 aa  282  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  38.15 
 
 		 390 aa  281  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  38.04 
 
 		 395 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  38.02 
 
 		 397 aa  270  8e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 		 399 aa  259  9e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  38.31 
 
 		 360 aa  229  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  36.07 
 
 		 337 aa  224  7e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  36.2 
 
 		 349 aa  220  7.999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  38.12 
 
 		 353 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  31.57 
 
 		 416 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 		 388 aa  197  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  35.6 
 
 		 405 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 		 393 aa  193  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  35.22 
 
 		 364 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 		 371 aa  192  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 		 399 aa  191  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 		 414 aa  190  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 		 392 aa  188  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  32.29 
 
 		 378 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  35.26 
 
 		 404 aa  180  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 		 393 aa  167  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 		 393 aa  167  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 		 393 aa  165  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  32.69 
 
 		 378 aa  165  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  32.57 
 
 		 371 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  34.02 
 
 		 339 aa  160  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  33.53 
 
 		 348 aa  157  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  35.43 
 
 		 340 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  33.82 
 
 		 340 aa  152  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  35.24 
 
 		 338 aa  150  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  30.9 
 
 		 367 aa  127  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  32.82 
 
 		 351 aa  110  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 672 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 		 388 aa  86.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 		 374 aa  84  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 422 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  28.09 
 
 		 650 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  25 
 
 		 384 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  25.97 
 
 		 416 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  27.27 
 
 		 383 aa  77  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  28.63 
 
 		 394 aa  76.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 		 378 aa  76.6  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 438 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  23.6 
 
 		 389 aa  73.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 		 383 aa  73.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  24.47 
 
 		 395 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  24.11 
 
 		 395 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.1 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  23.78 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 386 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.03 
 
 		 360 aa  70.1  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.37 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.37 
 
 		 499 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.37 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.37 
 
 		 495 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.37 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.37 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.37 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 		 406 aa  67.4  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 382 aa  67  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  23.77 
 
 		 378 aa  67.4  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 348 aa  67  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 390 aa  67.4  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>