More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0865 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  51.12 
 
 
774 aa  790    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  42.07 
 
 
759 aa  635    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
763 aa  1587    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  45.91 
 
 
790 aa  694    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  44.78 
 
 
780 aa  639    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  44.85 
 
 
789 aa  649    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  48.85 
 
 
765 aa  705    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  45.41 
 
 
761 aa  632  1e-180  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  41.89 
 
 
747 aa  614  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  42.21 
 
 
759 aa  608  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  39 
 
 
797 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  41.87 
 
 
767 aa  542  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  39.57 
 
 
823 aa  521  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
762 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
774 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 
756 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  42.26 
 
 
411 aa  330  7e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  42.75 
 
 
391 aa  323  8e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  41.91 
 
 
391 aa  318  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  38.56 
 
 
386 aa  313  7.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  37.4 
 
 
390 aa  287  5e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  37.17 
 
 
397 aa  274  6e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  37.73 
 
 
405 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  36.44 
 
 
395 aa  259  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  40.99 
 
 
364 aa  250  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  36.72 
 
 
349 aa  246  8e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  39.07 
 
 
353 aa  246  9e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  37.35 
 
 
337 aa  238  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  35.9 
 
 
360 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  36.48 
 
 
416 aa  224  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
399 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  36.75 
 
 
371 aa  213  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  35.99 
 
 
388 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  34.84 
 
 
393 aa  204  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  36.62 
 
 
371 aa  203  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  36.36 
 
 
378 aa  198  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  34.73 
 
 
392 aa  197  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
378 aa  195  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 
405 aa  194  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  37.04 
 
 
348 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
399 aa  191  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  38.91 
 
 
338 aa  188  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
414 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
393 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
393 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
393 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  35.36 
 
 
367 aa  167  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  34.58 
 
 
404 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  36.87 
 
 
340 aa  164  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  39.2 
 
 
351 aa  162  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  36.58 
 
 
340 aa  158  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  30.68 
 
 
339 aa  150  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
400 aa  82  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.29 
 
 
413 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  25.24 
 
 
395 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3305  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0317499  normal  0.753589 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  26.55 
 
 
392 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  23.34 
 
 
388 aa  76.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  23.54 
 
 
375 aa  76.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  26.03 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  21.67 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
358 aa  74.3  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
364 aa  73.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  30.04 
 
 
383 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
394 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  24.69 
 
 
375 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 
382 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
536 aa  70.1  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
401 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  18.73 
 
 
1232 aa  67.8  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  23.9 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
748 aa  67.4  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
350 aa  67.4  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  22.42 
 
 
374 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
381 aa  67.4  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
438 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
672 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  21.43 
 
 
410 aa  65.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 
386 aa  65.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 
396 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
415 aa  65.5  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
409 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
384 aa  64.7  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2441  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  24.77 
 
 
446 aa  65.1  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.662083  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  26.29 
 
 
371 aa  64.7  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
395 aa  64.7  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1692  glycosyl transferase, group 1  22.89 
 
 
375 aa  64.3  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  25.56 
 
 
416 aa  64.3  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
371 aa  64.3  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 
398 aa  64.3  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  25.84 
 
 
384 aa  64.3  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.88 
 
 
385 aa  63.5  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
396 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>