More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7428 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7428  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
388 aa  761    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223976  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0542  glycosyl transferase group 1  54.55 
 
 
414 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1052  glycosyl transferase, group 1  55.26 
 
 
371 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5289  glycosyl transferase group 1  56.92 
 
 
405 aa  363  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213842  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5216  glycosyl transferase, group 1  52.63 
 
 
392 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.088872  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  54.76 
 
 
399 aa  354  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  49.34 
 
 
378 aa  329  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5224  glycosyl transferase, group 1  48.53 
 
 
393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  48.32 
 
 
393 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  48.32 
 
 
393 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  48.05 
 
 
393 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  35.99 
 
 
763 aa  223  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  33.68 
 
 
390 aa  222  7e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1623  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
386 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0932889  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  33.95 
 
 
747 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 
391 aa  220  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1786  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
391 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  35.85 
 
 
759 aa  219  8.999999999999998e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
789 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
790 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  36.32 
 
 
761 aa  209  9e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 
395 aa  206  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  35.6 
 
 
823 aa  205  9e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
405 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
780 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  30.48 
 
 
797 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 
774 aa  199  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  34.77 
 
 
765 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
397 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
774 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
759 aa  186  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
756 aa  166  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
399 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 
762 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
767 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
394 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  32.43 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
1233 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4283  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772283 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
386 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  24.9 
 
 
374 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
387 aa  63.5  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3005  hypothetical protein  25.85 
 
 
395 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.036404  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 
382 aa  62.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0648  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.53 
 
 
431 aa  61.6  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.205035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3533  glycosyl transferase, group 1 family protein PslF  24.45 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0609585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  26.63 
 
 
395 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  22.49 
 
 
374 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  22.25 
 
 
387 aa  60.8  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
415 aa  60.5  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
370 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 
411 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
355 aa  59.7  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
394 aa  59.7  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
412 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
413 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 
358 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0387  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.78 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.270074  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  23.51 
 
 
383 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
419 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
399 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
412 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
414 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.39 
 
 
396 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
396 aa  57  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
385 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.4 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3016  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
373 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
371 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 
426 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
391 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
373 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
420 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
351 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 
398 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
393 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2576  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 
377 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496816  normal  0.101525 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  23.49 
 
 
392 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.78 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
426 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 
770 aa  54.7  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
374 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
392 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
398 aa  53.9  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.44 
 
 
410 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
416 aa  53.5  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>