More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0758 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
371 aa  744    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  43.24 
 
 
369 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
426 aa  159  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
396 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
391 aa  134  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
360 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 
355 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
396 aa  126  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
390 aa  125  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1223  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.764713  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
536 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 
353 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
395 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
382 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 
355 aa  116  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  26.68 
 
 
408 aa  116  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 
367 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
362 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.65 
 
 
409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  24.87 
 
 
372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
413 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 
689 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
396 aa  114  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
356 aa  113  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 
396 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
398 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  38.14 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
417 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
412 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
373 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
382 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
348 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
406 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  34.4 
 
 
385 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
406 aa  107  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  23.6 
 
 
410 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
406 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  40.11 
 
 
382 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  26.8 
 
 
358 aa  106  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 
410 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3316  glycosyltransferase-like protein  28.41 
 
 
395 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
414 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 
387 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
409 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  29.22 
 
 
351 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
405 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
380 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
379 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
386 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.82 
 
 
407 aa  104  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 
399 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 
397 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 
376 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 
382 aa  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
386 aa  103  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
357 aa  102  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
370 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 
358 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
375 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 
433 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0391  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 
378 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
394 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  32.9 
 
 
376 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
395 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
427 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
409 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  20.59 
 
 
364 aa  100  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
411 aa  101  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1064  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
400 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
396 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
396 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
374 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
464 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
392 aa  100  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 
371 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
402 aa  99.8  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
393 aa  99.8  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 
412 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 
395 aa  99.4  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 
378 aa  99.4  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
402 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
355 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
457 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 
371 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
414 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
376 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  26.36 
 
 
935 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  26.27 
 
 
347 aa  98.2  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  24.93 
 
 
354 aa  97.8  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>