More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1251 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  100 
 
 		 354 aa  722    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  64.89 
 
 		 359 aa  481  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  64.89 
 
 		 359 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1271  general glycosylation pathway protein  64.33 
 
 		 358 aa  477  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.507421  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  42.61 
 
 		 358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.31 
 
 		 352 aa  270  4e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  41.19 
 
 		 347 aa  269  4e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  40.4 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  39.77 
 
 		 347 aa  243  3e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  37.5 
 
 		 347 aa  226  4e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  38.14 
 
 		 346 aa  225  8e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  36.13 
 
 		 350 aa  206  4e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 374 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 386 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.52 
 
 		 366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  30.52 
 
 		 366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 409 aa  123  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.33 
 
 		 375 aa  119  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 		 361 aa  119  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05930  glycosyltransferase  24.6 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289999  hitchhiker  0.000000027455 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  29.6 
 
 		 353 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 357 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  23.51 
 
 		 440 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  30.05 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  29.59 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  30.33 
 
 		 365 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  22.72 
 
 		 890 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  24.61 
 
 		 390 aa  106  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0616  putative glycosyltransferase protein  24.44 
 
 		 428 aa  107  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 375 aa  106  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  29.65 
 
 		 366 aa  106  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  23.95 
 
 		 388 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.2 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  22.42 
 
 		 353 aa  99.4  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 		 384 aa  98.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  25.46 
 
 		 383 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 371 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  21.84 
 
 		 669 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 390 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  23.04 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.39 
 
 		 374 aa  93.2  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 		 419 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 365 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 		 762 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 		 360 aa  90.5  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  20.9 
 
 		 678 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  25.97 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  23.2 
 
 		 416 aa  90.1  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 		 399 aa  90.1  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 		 363 aa  90.1  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  35.95 
 
 		 378 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2217  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 395 aa  87.8  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1409  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  22.8 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 		 406 aa  87.4  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 		 371 aa  86.7  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  22.41 
 
 		 424 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 350 aa  86.7  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  29.41 
 
 		 419 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  23.33 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  22.01 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  23.54 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  26.18 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.71 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  20.71 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.93 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  21.68 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1512  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 		 394 aa  82.8  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.177652 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.06 
 
 		 465 aa  82  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.19 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  23.7 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  22.49 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.46 
 
 		 745 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  25.32 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.14 
 
 		 359 aa  79.3  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  21.84 
 
 		 660 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 1264 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>