More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2217 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2217  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
385 aa  796    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0187  glycosyl transferase, group 1  34.66 
 
 
376 aa  204  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0191  glycosyl transferase, group 1  35.92 
 
 
364 aa  193  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1616  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 
358 aa  188  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  29.75 
 
 
366 aa  124  3e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 
372 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  28.33 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
348 aa  109  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  28.41 
 
 
365 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  27.59 
 
 
365 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.48 
 
 
373 aa  104  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.99 
 
 
415 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  37.34 
 
 
420 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
350 aa  102  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  39.64 
 
 
376 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
396 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
386 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
346 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
375 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  31.05 
 
 
419 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  23.27 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
309 aa  93.6  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  25.91 
 
 
393 aa  92.8  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
419 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
374 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.46 
 
 
420 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.46 
 
 
420 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 
361 aa  89.4  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.46 
 
 
420 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
361 aa  89.4  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.46 
 
 
420 aa  89.4  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.46 
 
 
392 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.46 
 
 
392 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
361 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  25.8 
 
 
354 aa  89  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.46 
 
 
420 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
425 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
369 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
390 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.48 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.05 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  29.95 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  22.77 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
371 aa  84  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0295  phosphatidylinositol glycan-class A  28.37 
 
 
345 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3115  group 1 glycosyl transferase  30.15 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
361 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.3 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  26.95 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  25.32 
 
 
358 aa  79.3  0.00000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.89 
 
 
365 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  30.29 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  27.35 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  21.66 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  26.39 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
750 aa  76.3  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  24.05 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  26.92 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  24.78 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3395  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  25.6 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.6 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
384 aa  73.6  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 
388 aa  72.8  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.57 
 
 
419 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.94 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.59 
 
 
465 aa  72.8  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
360 aa  72  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 
359 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
365 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  29.3 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  22.62 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
363 aa  72  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
364 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>