More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4335 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  91.97 
 
 		 361 aa  670    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  99.45 
 
 		 361 aa  738    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  91.69 
 
 		 361 aa  670    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  91.41 
 
 		 361 aa  667    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  98.61 
 
 		 361 aa  735    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 361 aa  744    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  91.14 
 
 		 361 aa  666    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0113  glycosyl transferase group 1  70.08 
 
 		 361 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  64.53 
 
 		 365 aa  488  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  57.5 
 
 		 366 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  45.28 
 
 		 356 aa  318  6e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  44.72 
 
 		 356 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  44.85 
 
 		 356 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  44.69 
 
 		 356 aa  318  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.72 
 
 		 356 aa  317  3e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  45 
 
 		 356 aa  316  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  44.72 
 
 		 356 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  41.23 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 		 357 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 		 375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 		 373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  27.62 
 
 		 369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 		 346 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 396 aa  109  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  27.44 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.32 
 
 		 396 aa  106  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 361 aa  106  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.65 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  38.27 
 
 		 420 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 396 aa  99.4  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 374 aa  98.6  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.91 
 
 		 415 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 363 aa  98.6  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.61 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 		 393 aa  96.7  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  26.23 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 		 361 aa  94  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 419 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  26.58 
 
 		 365 aa  92  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  26.27 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.55 
 
 		 392 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.55 
 
 		 420 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.55 
 
 		 420 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.55 
 
 		 392 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 346 aa  89.7  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  26.2 
 
 		 365 aa  89.4  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.55 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.55 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.55 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 		 368 aa  89  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 		 1032 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 381 aa  87.4  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0077  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 398 aa  87.4  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 		 365 aa  86.7  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3918  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  28.44 
 
 		 363 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0109965 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3999  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  24.07 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.201364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4044  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  28.37 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3937  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  27.96 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4106  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  27.96 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  34.48 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  36.67 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2217  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 		 390 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5440  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.75 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  22.81 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2054  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.56 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  24.04 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  25.77 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5027  glycosyl transferase, group 1  36.19 
 
 		 856 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>