More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0565 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 381 aa  757    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0077  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 		 359 aa  159  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4044  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  33.33 
 
 		 359 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3918  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  32.98 
 
 		 363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0109965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3937  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  32.98 
 
 		 359 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3999  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  32.98 
 
 		 359 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.201364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4106  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  32.98 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3024  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 		 356 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1370  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  28.91 
 
 		 349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 		 376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  28.77 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 		 346 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 419 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 		 420 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.66 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.66 
 
 		 392 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 		 420 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 		 420 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 		 420 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 356 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 356 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 356 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  30.41 
 
 		 419 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.55 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  32.7 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 		 704 aa  94  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2054  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.03 
 
 		 496 aa  93.6  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 396 aa  92.8  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  22.28 
 
 		 390 aa  92.8  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 353 aa  92.8  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  25.75 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  34.95 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.12 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 382 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 365 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 		 363 aa  86.3  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  28.72 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  25 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.37 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  21.62 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0060  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 656 aa  84.7  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  31.05 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  21.78 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  39.33 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.54 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 890 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 335 aa  79.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.98 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 		 1032 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.57 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0217  glycosyltransferase  28.51 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  32.57 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  29.24 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0044  glycosyltransferase  26.67 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  41.57 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.98 
 
 		 465 aa  76.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  21.37 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  28.95 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 		 658 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  25.77 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  24.5 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  28.33 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  31.34 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>