More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0077 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0077  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 359 aa  747    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3918  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  64.07 
 
 		 363 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0109965 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4106  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  64.07 
 
 		 359 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3999  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  64.35 
 
 		 359 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.201364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4044  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  64.07 
 
 		 359 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3937  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  64.62 
 
 		 359 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3024  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1370  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  34.07 
 
 		 349 aa  186  8e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 		 381 aa  159  9e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  25.91 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.82 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  31.75 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 		 660 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  24.82 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  20.71 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.08 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  33.58 
 
 		 890 aa  77  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.21 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  22.62 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.82 
 
 		 420 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.82 
 
 		 392 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.25 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.25 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  22.25 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.25 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.25 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.6 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  31.37 
 
 		 377 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 		 409 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 		 762 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0101  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.38 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.64 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  28.02 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  26.2 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2054  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.93 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  30.18 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  25.56 
 
 		 745 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  21.1 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.64 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  33.33 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  23.17 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.54 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  22.83 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.54 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  32.54 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  32.54 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.54 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.54 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  32.54 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.54 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0113  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>