More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2820 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 370 aa  739    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  48.12 
 
 		 375 aa  333  4e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  47.38 
 
 		 368 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  38.36 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  40.79 
 
 		 375 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  39.33 
 
 		 393 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  37.82 
 
 		 346 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  35.17 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  36.49 
 
 		 361 aa  176  7e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  36.78 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  31.82 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 365 aa  162  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  34.63 
 
 		 361 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  36.82 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 		 364 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.99 
 
 		 356 aa  126  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 		 374 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 		 356 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 356 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 		 356 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 356 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 356 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 		 363 aa  122  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 361 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 		 379 aa  122  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 		 368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.37 
 
 		 365 aa  113  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.54 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.44 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0113  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.1 
 
 		 361 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 		 890 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  42.77 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 		 361 aa  106  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  27.37 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  28.17 
 
 		 393 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 		 419 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 		 361 aa  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 399 aa  102  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 359 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  36.14 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  40.41 
 
 		 370 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  39.05 
 
 		 388 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  29.97 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  32.4 
 
 		 425 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 		 386 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  39.09 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  40.27 
 
 		 419 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  26.42 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1409  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 		 418 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.06 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 		 401 aa  93.2  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  45.16 
 
 		 403 aa  92.8  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.86 
 
 		 373 aa  92.8  8e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 365 aa  92.8  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.25 
 
 		 374 aa  92.8  9e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  25.77 
 
 		 365 aa  92.4  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2494  glycosyl transferase, group 1  36.96 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 		 364 aa  92.8  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 		 357 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  40.58 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  24.26 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  47.41 
 
 		 443 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  24.93 
 
 		 358 aa  91.7  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  33.69 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4547  glycosyl transferase group 1  42.11 
 
 		 370 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.76 
 
 		 377 aa  90.5  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  25.84 
 
 		 365 aa  90.1  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.14 
 
 		 366 aa  89.7  8e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  25.14 
 
 		 366 aa  89.7  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.85 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 		 355 aa  89.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  37.3 
 
 		 436 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  37.57 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>