More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02449 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 376 aa  769    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  33.8 
 
 		 379 aa  209  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  29.77 
 
 		 366 aa  142  9e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  30.45 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  29.92 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  28.34 
 
 		 369 aa  132  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  29.4 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.89 
 
 		 374 aa  125  8.000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 		 375 aa  122  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  29.79 
 
 		 374 aa  120  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 		 359 aa  119  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.55 
 
 		 396 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 376 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.16 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 365 aa  111  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  35.03 
 
 		 368 aa  106  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 		 368 aa  106  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 		 370 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  29.87 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 		 399 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 		 363 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0586  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.17 
 
 		 380 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00449508  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 388 aa  97.1  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.25 
 
 		 361 aa  96.7  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  26.58 
 
 		 393 aa  96.7  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 346 aa  96.3  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 		 361 aa  94  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 		 361 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 356 aa  93.2  7e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 356 aa  92.8  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 356 aa  92.8  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 		 364 aa  92.8  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 358 aa  92  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 356 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.36 
 
 		 365 aa  90.5  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.33 
 
 		 356 aa  90.1  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  33.97 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  22.98 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 		 366 aa  88.6  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 409 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 		 356 aa  86.7  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 361 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 		 370 aa  86.3  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 		 373 aa  86.3  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 		 418 aa  82.8  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.03 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5440  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.93 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2217  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.33 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.33 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.33 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.33 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.33 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.33 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  31.77 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.33 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  26.74 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0113  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.43 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 355 aa  77.8  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  22.34 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.42 
 
 		 465 aa  76.3  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3918  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  30.06 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0109965 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  32.04 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  28.25 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>