More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3171 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
370 aa  751    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  37.33 
 
 
346 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  35.05 
 
 
390 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
371 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 
376 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  32.3 
 
 
369 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  34.35 
 
 
309 aa  146  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
365 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
365 aa  115  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
361 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 
368 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.63 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  41.45 
 
 
394 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
386 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
363 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
660 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  31.3 
 
 
399 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30 
 
 
386 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
364 aa  96.7  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  26.48 
 
 
321 aa  95.9  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
669 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
373 aa  95.1  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
361 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
364 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.64 
 
 
372 aa  94  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
368 aa  93.6  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
1032 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 
381 aa  92.8  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 
409 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
420 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
358 aa  90.5  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  30.57 
 
 
399 aa  89.7  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 
359 aa  89.4  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
393 aa  89.4  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
361 aa  89.4  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
361 aa  89.4  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.3 
 
 
361 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
678 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.53 
 
 
356 aa  87.4  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
361 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.56 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
357 aa  87.4  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  30.14 
 
 
379 aa  87  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
361 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 
388 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  29.23 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
361 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  31.42 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  31.22 
 
 
419 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.82 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2494  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.07 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 
383 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.07 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.07 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.07 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.07 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.07 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
396 aa  84  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  21.7 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
418 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
356 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
398 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
356 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
353 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  31.72 
 
 
440 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  38.76 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2054  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.38 
 
 
496 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.59 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  37.78 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
357 aa  79.3  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
356 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 
762 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0113  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 
361 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  25.38 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
381 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.67 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3024  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.35 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
379 aa  77  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  30.92 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0077  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  40.94 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
871 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>