More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4472 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  92.98 
 
 
356 aa  696    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
356 aa  741    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  99.16 
 
 
356 aa  735    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  99.16 
 
 
356 aa  737    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  92.96 
 
 
356 aa  694    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  92.7 
 
 
356 aa  695    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  93.5 
 
 
356 aa  696    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  71.83 
 
 
358 aa  541  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  45.56 
 
 
361 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  45.56 
 
 
361 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  45.28 
 
 
361 aa  306  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.56 
 
 
361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  45 
 
 
361 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  45 
 
 
361 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  44.72 
 
 
361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0113  glycosyl transferase group 1  44.44 
 
 
361 aa  295  8e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.92 
 
 
365 aa  293  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  43.53 
 
 
366 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
359 aa  153  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  37.26 
 
 
357 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  37.21 
 
 
309 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  36.15 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  27.57 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 
399 aa  115  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  36.22 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
375 aa  107  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  35.32 
 
 
371 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.95 
 
 
396 aa  106  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 
393 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.44 
 
 
372 aa  102  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
396 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
420 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  29.19 
 
 
379 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
381 aa  97.1  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  34.1 
 
 
348 aa  96.7  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  34.5 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  34.5 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  34.5 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 
374 aa  92.4  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.88 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
376 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.36 
 
 
392 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.03 
 
 
373 aa  91.3  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.36 
 
 
420 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.36 
 
 
420 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.61 
 
 
392 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 
363 aa  89.7  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  36.32 
 
 
368 aa  89.7  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.61 
 
 
420 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.61 
 
 
420 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.61 
 
 
420 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
361 aa  89.4  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  25 
 
 
366 aa  87.4  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
386 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
419 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  33.54 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  34.64 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
1032 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
364 aa  77  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
660 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 
386 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  23.74 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2217  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  34.15 
 
 
490 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  34.15 
 
 
490 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.62 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  28.02 
 
 
399 aa  72.8  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
398 aa  72.8  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  33.57 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  31.43 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.07 
 
 
465 aa  71.2  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3918  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  27.11 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0109965 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
409 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  25 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.67 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
739 aa  70.1  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5027  glycosyl transferase, group 1  34.4 
 
 
856 aa  69.3  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>