More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3069 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
399 aa  797    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  35.47 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.5 
 
 
396 aa  162  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 
371 aa  159  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  36.13 
 
 
375 aa  150  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  28.73 
 
 
366 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  30.03 
 
 
365 aa  146  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  29.55 
 
 
365 aa  146  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
396 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  44.67 
 
 
419 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  29.6 
 
 
365 aa  144  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  45.36 
 
 
419 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  40.17 
 
 
374 aa  137  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  31.29 
 
 
379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
348 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 
386 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.35 
 
 
373 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  41.87 
 
 
384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  29.41 
 
 
366 aa  129  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
346 aa  129  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  31.54 
 
 
369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.41 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.91 
 
 
372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  27.4 
 
 
393 aa  124  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 
396 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
409 aa  122  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.07 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.7 
 
 
420 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.29 
 
 
415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
356 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
309 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.62 
 
 
392 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.68 
 
 
374 aa  119  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.62 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.16 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.16 
 
 
420 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.16 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.16 
 
 
420 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
386 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  27.39 
 
 
374 aa  117  5e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 
364 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
356 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.99 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  36.87 
 
 
660 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 
361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  36.42 
 
 
356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  36.42 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  36.42 
 
 
356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  37.25 
 
 
420 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 
365 aa  113  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 
360 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  28.12 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  29.04 
 
 
1032 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  28.54 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.17 
 
 
361 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
368 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  39.47 
 
 
394 aa  110  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
360 aa  110  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
361 aa  110  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  28.24 
 
 
347 aa  108  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
388 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
418 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
361 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
374 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  35.05 
 
 
381 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
361 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
361 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  37.57 
 
 
357 aa  106  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  33.84 
 
 
390 aa  106  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0113  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 
361 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
371 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
373 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
361 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 
364 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
376 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
381 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
358 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  24.09 
 
 
358 aa  101  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
363 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  35.45 
 
 
385 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  35.37 
 
 
399 aa  101  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
384 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  37.65 
 
 
364 aa  100  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 
374 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
379 aa  99.8  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
391 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
387 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  34.63 
 
 
426 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
350 aa  99.4  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>