More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2492 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 371 aa  738    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0616  putative glycosyltransferase protein  35.96 
 
 		 428 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  36.1 
 
 		 353 aa  170  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 386 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  34.53 
 
 		 396 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 374 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  35.68 
 
 		 388 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 355 aa  142  9e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.83 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  30.4 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  25.75 
 
 		 354 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  29.56 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  27.96 
 
 		 359 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  43.55 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  27.42 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  32.09 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  31.81 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  34.24 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1271  general glycosylation pathway protein  26.61 
 
 		 358 aa  123  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.507421  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 		 890 aa  123  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 		 762 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  28.76 
 
 		 347 aa  116  6e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 		 361 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.07 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 660 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 		 418 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 362 aa  112  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 808 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  26.89 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  28.2 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13941  glycosyl transferase, group 1  23.92 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.164245  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 364 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  26.61 
 
 		 347 aa  110  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  24.54 
 
 		 346 aa  109  9.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  23.14 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  36.5 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  20.77 
 
 		 365 aa  106  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 364 aa  106  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 383 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 		 381 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  36.68 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  25.27 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  36.04 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 		 443 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  26.2 
 
 		 353 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  27.47 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  29.28 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  39.22 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  30.33 
 
 		 435 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  36.6 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 414 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  24.35 
 
 		 347 aa  98.2  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 384 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 		 419 aa  97.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 392 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 669 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 		 414 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 		 1264 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 		 368 aa  96.7  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 678 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 		 383 aa  96.3  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 		 371 aa  96.3  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.28 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  36 
 
 		 374 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  27.03 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.78 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.78 
 
 		 420 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.78 
 
 		 420 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.78 
 
 		 420 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 		 309 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2090  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.28 
 
 		 392 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.28 
 
 		 420 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 377 aa  93.6  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 		 425 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 386 aa  93.2  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  26.07 
 
 		 346 aa  93.2  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 		 361 aa  92.8  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 435 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>