More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0170 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
384 aa  771    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  60 
 
 
404 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0200  putative glycosyl transferase, group 1  60.53 
 
 
392 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  37.67 
 
 
386 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 
374 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 
388 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
357 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.26 
 
 
366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  26.88 
 
 
358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  27.99 
 
 
366 aa  111  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
353 aa  109  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
390 aa  109  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 
375 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 
393 aa  107  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 
364 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 
365 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
409 aa  102  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  29.05 
 
 
416 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 
364 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  23.71 
 
 
346 aa  100  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  25.71 
 
 
350 aa  99  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  24.24 
 
 
354 aa  98.6  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
425 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 
375 aa  97.8  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  27.76 
 
 
359 aa  97.4  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  26.68 
 
 
347 aa  96.7  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  27.22 
 
 
358 aa  96.3  8e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 
419 aa  94.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  28.08 
 
 
440 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  26.87 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1271  general glycosylation pathway protein  27.16 
 
 
358 aa  94.7  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.507421  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
372 aa  92.8  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  37.19 
 
 
418 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
388 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  23.22 
 
 
347 aa  90.1  6e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
762 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
808 aa  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  39.31 
 
 
418 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  22.19 
 
 
363 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.25 
 
 
375 aa  87  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
353 aa  87  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  24.81 
 
 
321 aa  87  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 
370 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
352 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 
890 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  31.84 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
443 aa  83.2  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  34.32 
 
 
435 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.24 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  34.24 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3566  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
365 aa  77  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  35.63 
 
 
654 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1409  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
660 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  25.76 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  25.75 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  35.52 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1512  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.177652 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.5 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  24.39 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  34.94 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3128  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  33.54 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360612  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05930  glycosyltransferase  24.87 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289999  hitchhiker  0.000000027455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 
810 aa  72.8  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 
423 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  36.76 
 
 
407 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  35.33 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
392 aa  72.4  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2882  glycosyl transferase, group 1  23.85 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  35.66 
 
 
448 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  39.06 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>