More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3566 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3566  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 389 aa  771    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  34.63 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  34.98 
 
 		 412 aa  97.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  36.76 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 404 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  37.62 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  35.89 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  37.56 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  38.05 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0296  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  43.05 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  35.76 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  45.11 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  27.78 
 
 		 745 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  41.14 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0231  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 		 378 aa  79.3  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282789 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.87 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7628  Glycosyltransferase-like protein  34.25 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294474  normal  0.180766 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.5 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  35.66 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  40.4 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.98 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  36.02 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  35.89 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 		 744 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.75 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  33.03 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  23.01 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1909  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.31 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  27.31 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  27.31 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.31 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  36.82 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.31 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  37.58 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  27.31 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.75 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 		 904 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  29.21 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  39.29 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  34.39 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.95 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 765 aa  73.6  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3845  group 1 glycosyl transferase  29.03 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452091  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  37.22 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  38.07 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 756 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.95 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  27.11 
 
 		 745 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  36.23 
 
 		 381 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  23.72 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  21.43 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  36.73 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 763 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 382 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  28.28 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  40.88 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  28.21 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  38.1 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>