More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2721 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 364 aa  739    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  60.57 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  42.93 
 
 		 388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1512  glycosyl transferase group 1  38.67 
 
 		 394 aa  189  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.177652 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  37.72 
 
 		 418 aa  159  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 390 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 		 660 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.33 
 
 		 375 aa  156  7e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  37.3 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 		 365 aa  153  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  38.38 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  32.76 
 
 		 385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 		 371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 353 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  40.62 
 
 		 416 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 669 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 409 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  28.29 
 
 		 358 aa  142  6e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 		 390 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  34.64 
 
 		 440 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 364 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  39.29 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 		 357 aa  135  9e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 		 388 aa  132  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 678 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 890 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.77 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  41.86 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  25.14 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  26.09 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  26.36 
 
 		 359 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1271  general glycosylation pathway protein  26.03 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.507421  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  33.33 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  30.06 
 
 		 347 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  39.9 
 
 		 398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  27.54 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0616  putative glycosyltransferase protein  33.55 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 762 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  32.01 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 		 808 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  27.75 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  30.75 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  44.64 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  41.82 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  25.14 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0200  putative glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  33.69 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  39.72 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  23.71 
 
 		 363 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  46.27 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.58 
 
 		 409 aa  105  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  30.8 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  38.43 
 
 		 750 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  29.18 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  23.16 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 371 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 		 371 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  27.05 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  35.12 
 
 		 393 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.16 
 
 		 420 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.16 
 
 		 392 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.16 
 
 		 420 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  38.2 
 
 		 392 aa  102  9e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.05 
 
 		 373 aa  102  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1409  glycosyl transferase group 1  23.59 
 
 		 356 aa  102  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  38.27 
 
 		 361 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.49 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.16 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.16 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.16 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.16 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.04 
 
 		 415 aa  99.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  25.56 
 
 		 490 aa  99.4  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  25.56 
 
 		 490 aa  99.4  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1956  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.13 
 
 		 381 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  25.43 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2090  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1200  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 384 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.86 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 		 370 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  35.84 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 		 374 aa  97.4  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  41.22 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  38.65 
 
 		 419 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 		 375 aa  97.1  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  42.38 
 
 		 350 aa  97.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 		 355 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>