More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0673 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
371 aa  746    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  68.23 
 
 
439 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  54.64 
 
 
371 aa  361  1e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  39 
 
 
401 aa  179  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
403 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  34.75 
 
 
388 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
385 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
379 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 
380 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  31.83 
 
 
384 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
381 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 
378 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
387 aa  145  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  38.4 
 
 
402 aa  142  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  36.43 
 
 
411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 
382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  36.89 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  36.45 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.2 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
395 aa  133  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  32.7 
 
 
389 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 
392 aa  133  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 
393 aa  132  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  36.3 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  43.38 
 
 
390 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
376 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.83 
 
 
365 aa  129  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.7 
 
 
419 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  40.39 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
385 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
385 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
412 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
378 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  28.53 
 
 
371 aa  126  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
381 aa  126  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
370 aa  126  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
377 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
387 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 
403 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
386 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2765  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
379 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  34.12 
 
 
398 aa  123  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2949  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
379 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 
394 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2857  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
379 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 
374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.19 
 
 
365 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 
373 aa  119  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  36.12 
 
 
372 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  36.76 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  37.45 
 
 
739 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  34.49 
 
 
377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  35.21 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
345 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
378 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0914  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.13 
 
 
375 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000157523  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 
388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  26.02 
 
 
369 aa  117  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
398 aa  116  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  38.29 
 
 
378 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  30.67 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 
391 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  28.14 
 
 
368 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
366 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  33.99 
 
 
386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
373 aa  113  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.87 
 
 
396 aa  113  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
369 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
360 aa  113  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
382 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
409 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  23.03 
 
 
367 aa  112  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 
373 aa  112  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  41.55 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  38.66 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  29.08 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
364 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
750 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>