More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2004 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
403 aa  818    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  37.7 
 
 
393 aa  195  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1641  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
390 aa  186  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
378 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 
387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 
380 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  37.37 
 
 
822 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
380 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 
394 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.21 
 
 
419 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2765  glycosyl transferase, group 1  36.39 
 
 
379 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117052  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2857  glycosyl transferase group 1  37.15 
 
 
379 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  40.89 
 
 
384 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2949  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 
379 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  36.57 
 
 
387 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  35.53 
 
 
401 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
377 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2639  glycosyl transferase, group 1  37.33 
 
 
380 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.5 
 
 
366 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
364 aa  150  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
385 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  37.08 
 
 
398 aa  142  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  31.08 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
391 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
395 aa  139  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  34.14 
 
 
383 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
390 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
388 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
382 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
360 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 
377 aa  132  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  31.42 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 
381 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 
392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 
371 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  31.92 
 
 
439 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
370 aa  126  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  27.01 
 
 
745 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 
406 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
360 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  36.94 
 
 
361 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
364 aa  124  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
388 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  36.74 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  34.7 
 
 
401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
369 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 
386 aa  120  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
364 aa  119  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  29.73 
 
 
387 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 
426 aa  119  9e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  34.84 
 
 
412 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
389 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
371 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 
366 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
373 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
383 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  28.62 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 
373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4266  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 
395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.07 
 
 
388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 
385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
378 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  31.4 
 
 
468 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
413 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 
399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 
380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  45.66 
 
 
384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
389 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  31.33 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  36.16 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.07 
 
 
381 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 
391 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1957  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.64 
 
 
366 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  39.1 
 
 
409 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
440 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
386 aa  109  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  35.77 
 
 
381 aa  109  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
363 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
412 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  28.99 
 
 
430 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  35.89 
 
 
402 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
394 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>