More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4266 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4266  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
395 aa  784    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  80.46 
 
 
394 aa  634  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  51.28 
 
 
406 aa  341  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  51.64 
 
 
406 aa  329  6e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.57 
 
 
377 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4006  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927279  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  36.76 
 
 
385 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  30.38 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 
401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  35.17 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 
364 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 
387 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  27.99 
 
 
360 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
390 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 
383 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
394 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  39.55 
 
 
387 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
398 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
393 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 
392 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
398 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
373 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.8 
 
 
365 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.11 
 
 
366 aa  100  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.61 
 
 
371 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
379 aa  99.4  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  33.92 
 
 
378 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
371 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
376 aa  96.7  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
403 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
384 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
384 aa  94.7  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 
366 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 
398 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
396 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  33.2 
 
 
377 aa  93.2  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
399 aa  92.8  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
391 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
382 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  32.59 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.93 
 
 
419 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
365 aa  91.3  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
387 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
381 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 
371 aa  90.1  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  26.95 
 
 
395 aa  90.1  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
406 aa  89.4  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
378 aa  89.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
374 aa  89.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
378 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 
389 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
378 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
378 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
440 aa  86.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  36.87 
 
 
380 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
378 aa  86.3  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
382 aa  86.3  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 
378 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 
378 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
360 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  37.18 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
424 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.01 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  37.62 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
426 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
367 aa  84  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.69 
 
 
378 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  36.07 
 
 
423 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  30.54 
 
 
408 aa  84  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
419 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  35.88 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  31.54 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
821 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
439 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 
384 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
819 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.51 
 
 
378 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
399 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
395 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
370 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>