More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2654 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
381 aa  771    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  77.15 
 
 
373 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  59.47 
 
 
382 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  47.37 
 
 
598 aa  301  9e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  41.78 
 
 
404 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  40.81 
 
 
371 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  40.8 
 
 
373 aa  269  7e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  44.51 
 
 
374 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  43.34 
 
 
384 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001768  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 
383 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1527  glycosyltransferase  38.92 
 
 
371 aa  253  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5372  glycosyl transferase, group 1  42.05 
 
 
372 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540545  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  40.64 
 
 
381 aa  251  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4567  glycosyl transferase group 1  37.63 
 
 
408 aa  246  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.392838 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1663  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2194  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.17 
 
 
378 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.17 
 
 
378 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3123  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.17 
 
 
385 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0713  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.17 
 
 
385 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.17 
 
 
385 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3086  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.17 
 
 
385 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2067  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.17 
 
 
385 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0833703  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
381 aa  232  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4709  glycosyl transferase group 1  36.03 
 
 
396 aa  229  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  39.78 
 
 
378 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  39.56 
 
 
378 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3704  putative glycosyl transferase  38.48 
 
 
382 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  39.29 
 
 
378 aa  226  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  39.23 
 
 
382 aa  225  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  38.27 
 
 
390 aa  225  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  37.9 
 
 
378 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1603  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
382 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000602977  normal  0.073151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
375 aa  224  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.06 
 
 
378 aa  223  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  38.74 
 
 
378 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  38.19 
 
 
378 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  38.19 
 
 
378 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.58 
 
 
380 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  35.58 
 
 
377 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1721  glycosyl transferase, group 1  35.99 
 
 
381 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.394257  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3174  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.02 
 
 
377 aa  203  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 
387 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
362 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  33.63 
 
 
388 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  34.5 
 
 
382 aa  194  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 
379 aa  192  8e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3842  a-glycosyltransferase  31.35 
 
 
378 aa  192  9e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5067  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
369 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 
371 aa  191  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0613  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.89 
 
 
341 aa  187  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3987  glycosyl transferase, group 1  37.42 
 
 
376 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.4 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.656157  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
394 aa  169  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2171  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 
390 aa  169  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178568  hitchhiker  0.0000236553 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1550  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 
379 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  34.06 
 
 
386 aa  166  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 
385 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  32.19 
 
 
371 aa  159  6e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  39.74 
 
 
339 aa  152  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0451  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  27.71 
 
 
371 aa  151  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1382  galactosyltransferase  26.47 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 
374 aa  144  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  28.31 
 
 
383 aa  137  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
390 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0878  galactosyltransferase  27.95 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.184172 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0781  galactosyltransferase  27.95 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.176556  normal  0.0501278 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2263  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.3 
 
 
377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1142  general glycosylation pathway protein  24.54 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1254  GalNAc alpha-1,3-transferase  25 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1267  general glycosylation pathway protein  24.02 
 
 
376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.832123  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  25 
 
 
371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
398 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  30.97 
 
 
362 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1928  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 
385 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0658107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2250  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
382 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0596  general glycosylation pathway protein  24.04 
 
 
376 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.17528  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1973  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
389 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
375 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
403 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  32.07 
 
 
387 aa  113  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0758  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.647654 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1473  RfpB  35.42 
 
 
148 aa  105  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000168488  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
379 aa  103  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  34.81 
 
 
364 aa  99.4  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
381 aa  99  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 
364 aa  97.8  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
414 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
408 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
364 aa  92.8  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.07 
 
 
356 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5353  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 
379 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
379 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
391 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  30.9 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
381 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
364 aa  87  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>