More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1350 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  82.51 
 
 		 406 aa  643    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 406 aa  810    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  51.53 
 
 		 394 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4266  glycosyl transferase, group 1  51.28 
 
 		 395 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4006  glycosyl transferase, group 1  30.89 
 
 		 394 aa  176  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927279  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 		 377 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 379 aa  135  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  31.66 
 
 		 403 aa  123  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 393 aa  122  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 		 378 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  26.55 
 
 		 745 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 392 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 		 361 aa  109  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  33.23 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 378 aa  107  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 371 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 		 391 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1311  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 		 452 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0221221  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 		 383 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 		 380 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 		 380 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.3 
 
 		 371 aa  103  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.68 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  29.77 
 
 		 409 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.53 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 		 373 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 364 aa  99.8  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 		 382 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1623  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 		 409 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1905  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 		 409 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3159  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.82 
 
 		 745 aa  96.7  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 387 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 		 425 aa  96.3  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  28.13 
 
 		 395 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.62 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  22.66 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 		 374 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 		 364 aa  93.2  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 389 aa  93.2  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1276  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.47 
 
 		 365 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.63 
 
 		 367 aa  90.1  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  23.15 
 
 		 366 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 		 368 aa  90.1  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.85 
 
 		 381 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  23.85 
 
 		 381 aa  89.7  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  23.15 
 
 		 366 aa  89.7  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  23.85 
 
 		 381 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  23.85 
 
 		 381 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 		 371 aa  89.7  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.85 
 
 		 381 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2857  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 		 379 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 		 387 aa  89.7  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.75 
 
 		 366 aa  89.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.08 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  28.4 
 
 		 822 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.15 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.34 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2188  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.91 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  22.91 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.35 
 
 		 381 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2949  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244554  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2765  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 		 379 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.82 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 434 aa  87  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 		 399 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  26.32 
 
 		 358 aa  86.7  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 		 367 aa  86.7  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>