More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1623 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  94.87 
 
 		 409 aa  754    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1905  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 409 aa  807    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1623  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 409 aa  807    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129932 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3159  glycosyl transferase group 1  79.65 
 
 		 428 aa  599  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4741  glycosyl transferase group 1  75.62 
 
 		 409 aa  551  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.506008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4231  glycosyl transferase group 1  76.49 
 
 		 431 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979422 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1198  glycosyl transferase group 1  48.97 
 
 		 388 aa  332  8e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0121  glycosyl transferase, group 1  49.62 
 
 		 382 aa  330  3e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  50.52 
 
 		 379 aa  325  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2108  glycosyl transferase group 1  45.65 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000441708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  47.77 
 
 		 432 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0640  glycosyl transferase group 1  44.71 
 
 		 418 aa  300  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  41.84 
 
 		 434 aa  255  8e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2194  glycosyl transferase, group 1  44.88 
 
 		 379 aa  229  9e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0354582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1443  glycosyl transferase group 1  38.44 
 
 		 383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1868  putative glycosyltransferase  36.25 
 
 		 376 aa  170  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2130  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  27.94 
 
 		 358 aa  159  6e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0560  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 		 374 aa  159  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0467  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 		 344 aa  153  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3769  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3348  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0442  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 370 aa  123  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02625  glycosyltransferase  32.05 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0082  hypothetical protein  31.74 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0068  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  37.36 
 
 		 482 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 335 aa  96.7  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  34.48 
 
 		 468 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  36.98 
 
 		 448 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 393 aa  94  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 425 aa  90.5  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0841  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 		 383 aa  88.2  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 426 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 		 385 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 		 394 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 		 422 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 		 410 aa  86.7  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 378 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  23.25 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.63 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  32.68 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  33.12 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 477 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  26.12 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 		 819 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  25.64 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1285  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.104889  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  33.46 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.66 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 		 821 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 		 821 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.79 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6091  glycosyl transferase group 1  39.02 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  decreased coverage  0.00114888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  35.22 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1742  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.711443  normal  0.704345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0313  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1089  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0606318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 		 391 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  33.85 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 		 822 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.92 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.58 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  33.47 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.13 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  28.89 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>