More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1311 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1311  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
452 aa  885    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0221221  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4006  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
394 aa  87  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927279  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
406 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4266  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
395 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 
385 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 
436 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.18 
 
 
369 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
419 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.22 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  25.52 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.82 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  26.82 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  25.75 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.82 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  26.82 
 
 
366 aa  67  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  29.55 
 
 
427 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  26.24 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  22.99 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
387 aa  65.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  25.93 
 
 
371 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  30.26 
 
 
413 aa  64.7  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
390 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0690  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
385 aa  63.9  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.945195  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 
389 aa  63.9  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
385 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 
439 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  35.85 
 
 
344 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 
439 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 
439 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
422 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
482 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
402 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
419 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
415 aa  61.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
368 aa  61.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
394 aa  60.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
414 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
438 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 
438 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
438 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1461  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
362 aa  59.3  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  44.55 
 
 
373 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  33.9 
 
 
379 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
411 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
425 aa  58.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  35.35 
 
 
344 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
374 aa  57.8  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0779  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
368 aa  57.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
448 aa  57.4  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
360 aa  57  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 
378 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
426 aa  57  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
377 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
384 aa  56.6  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 
373 aa  56.6  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  40.2 
 
 
370 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
385 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  24.37 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  30.33 
 
 
417 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  31.67 
 
 
450 aa  55.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  33.84 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0120  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 
325 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  28.18 
 
 
468 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
411 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
357 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  20.16 
 
 
387 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  28.82 
 
 
403 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  31.3 
 
 
431 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  45.59 
 
 
672 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.57 
 
 
405 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
421 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
440 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  24.66 
 
 
372 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  44.12 
 
 
435 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
405 aa  55.1  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
421 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  28.22 
 
 
480 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
426 aa  54.7  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
419 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
457 aa  54.3  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  54.55 
 
 
344 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
419 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
410 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1913  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 
378 aa  53.9  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
381 aa  53.5  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  27.67 
 
 
443 aa  53.5  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
423 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
371 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 
424 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
398 aa  53.1  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  25.98 
 
 
404 aa  53.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>