More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2702 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  50.66 
 
 		 745 aa  764    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 		 745 aa  1510    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  42.74 
 
 		 375 aa  312  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  37.91 
 
 		 377 aa  259  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  35.54 
 
 		 366 aa  252  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  35.07 
 
 		 388 aa  243  7.999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  37.19 
 
 		 373 aa  242  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  40.19 
 
 		 612 aa  239  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  36.03 
 
 		 356 aa  238  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  38.06 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 		 369 aa  224  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  33.91 
 
 		 367 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  32.78 
 
 		 367 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  32.78 
 
 		 367 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  32.78 
 
 		 367 aa  201  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  32.78 
 
 		 367 aa  201  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  33.77 
 
 		 366 aa  201  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.77 
 
 		 366 aa  200  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  33.77 
 
 		 366 aa  200  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  33.77 
 
 		 366 aa  200  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  36.33 
 
 		 369 aa  200  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.68 
 
 		 366 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  33.15 
 
 		 367 aa  198  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  31.13 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  32.34 
 
 		 362 aa  194  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  31.06 
 
 		 375 aa  193  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  30.85 
 
 		 362 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  34.25 
 
 		 370 aa  185  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  33.91 
 
 		 369 aa  178  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 377 aa  178  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  31.16 
 
 		 400 aa  177  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 367 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 369 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  29.5 
 
 		 369 aa  154  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.24 
 
 		 369 aa  151  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.98 
 
 		 369 aa  150  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3375  polysaccharide pyruvyl transferase  34.1 
 
 		 348 aa  150  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2747  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  33.99 
 
 		 348 aa  150  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  28.95 
 
 		 371 aa  150  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 		 394 aa  150  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 398 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 374 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1529  hypothetical protein  30.16 
 
 		 339 aa  146  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0032024 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  31.23 
 
 		 348 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  31.23 
 
 		 348 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 380 aa  144  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 387 aa  144  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  27.75 
 
 		 395 aa  144  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 374 aa  144  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.76 
 
 		 373 aa  144  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1755  polysaccharide pyruvyl transferase  33 
 
 		 347 aa  144  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 393 aa  143  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 		 398 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 378 aa  131  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  27.43 
 
 		 378 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0200  polysaccharide pyruvyl transferase  31.1 
 
 		 323 aa  130  8.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.666339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  29.59 
 
 		 383 aa  129  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.13 
 
 		 365 aa  129  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4433  polysaccharide pyruvyl transferase  28.95 
 
 		 350 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2213  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 384 aa  127  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.013573  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  33.09 
 
 		 407 aa  127  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 376 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 364 aa  126  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  29.64 
 
 		 366 aa  125  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 390 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.4 
 
 		 419 aa  125  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 371 aa  124  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 388 aa  124  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 379 aa  124  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 412 aa  124  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  24.61 
 
 		 370 aa  124  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1476  hypothetical protein  25.88 
 
 		 374 aa  123  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.470406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 		 392 aa  123  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 374 aa  121  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2362  polysaccharide pyruvyl transferase  31.44 
 
 		 332 aa  120  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0735051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  25.75 
 
 		 382 aa  120  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 		 383 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 382 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 366 aa  119  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4479  polysaccharide pyruvyl transferase  27.96 
 
 		 351 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 389 aa  119  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 390 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 376 aa  118  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  26.93 
 
 		 371 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 412 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  25.2 
 
 		 382 aa  117  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 395 aa  117  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 366 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 		 386 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 		 373 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 		 387 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 		 403 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 		 381 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1425  hypothetical protein  22.68 
 
 		 360 aa  114  9e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 		 360 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 381 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 385 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  23.39 
 
 		 381 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>