58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2271 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 
378 aa  751    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  67.93 
 
 
383 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  62.36 
 
 
382 aa  411  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  62.36 
 
 
382 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1476  hypothetical protein  45.68 
 
 
374 aa  259  8e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.470406  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  34.82 
 
 
388 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  31.84 
 
 
377 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  26.83 
 
 
745 aa  135  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  33.6 
 
 
367 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  26.29 
 
 
612 aa  123  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  27.12 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  27.09 
 
 
745 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  26.98 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  26.98 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  26.98 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  31.89 
 
 
366 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  26.18 
 
 
367 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  26.14 
 
 
362 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  26.43 
 
 
369 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  26.43 
 
 
375 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  30 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  25.3 
 
 
362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  28.38 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  25.91 
 
 
362 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  27.04 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  27.02 
 
 
369 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  28.53 
 
 
400 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  24.17 
 
 
438 aa  103  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  32.17 
 
 
370 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  28.3 
 
 
367 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2747  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  25.29 
 
 
348 aa  90.1  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3375  polysaccharide pyruvyl transferase  26.58 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  25.36 
 
 
1225 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1529  hypothetical protein  25.81 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1056  hypothetical protein  26.97 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1425  hypothetical protein  25.98 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4433  polysaccharide pyruvyl transferase  24.92 
 
 
350 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  24.59 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  24.59 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  21.75 
 
 
408 aa  63.5  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2202  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  27.81 
 
 
332 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2362  polysaccharide pyruvyl transferase  30.5 
 
 
332 aa  62.8  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0735051  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1074  hypothetical protein  25.14 
 
 
351 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  20.14 
 
 
407 aa  59.7  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1755  polysaccharide pyruvyl transferase  22.92 
 
 
347 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1801  hypothetical protein  22.64 
 
 
368 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  25.94 
 
 
430 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4479  polysaccharide pyruvyl transferase  25.48 
 
 
351 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  23.53 
 
 
428 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15321  hypothetical protein  23.95 
 
 
367 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0618  hypothetical protein  19.79 
 
 
405 aa  50.8  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  normal  0.0191891 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0200  polysaccharide pyruvyl transferase  29.97 
 
 
323 aa  50.1  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.666339 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  22.08 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  24.47 
 
 
431 aa  47.4  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0960  polysaccharide pyruvyl transferase  20.3 
 
 
418 aa  46.6  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0419  hypothetical protein  25.71 
 
 
413 aa  46.2  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3929  hypothetical protein  21.28 
 
 
431 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0373  hypothetical protein  25.29 
 
 
413 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0482859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>