58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1074 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1074  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  696    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1425  hypothetical protein  62.75 
 
 		 360 aa  408  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15321  hypothetical protein  52.92 
 
 		 367 aa  308  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3375  polysaccharide pyruvyl transferase  35.23 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4433  polysaccharide pyruvyl transferase  34.19 
 
 		 350 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2747  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  31.43 
 
 		 348 aa  149  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  33.43 
 
 		 348 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  33.43 
 
 		 348 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1529  hypothetical protein  33.91 
 
 		 339 aa  142  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0032024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1755  polysaccharide pyruvyl transferase  31.52 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  34.2 
 
 		 366 aa  129  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  27.38 
 
 		 362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  32.25 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  27.06 
 
 		 362 aa  126  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  27.87 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  27.62 
 
 		 375 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  28.06 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  26.82 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  26.97 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  26.97 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  26.97 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  26.97 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4479  polysaccharide pyruvyl transferase  36.18 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  30.84 
 
 		 377 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  27.39 
 
 		 373 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  23.5 
 
 		 612 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  30.72 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.14 
 
 		 745 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  27.4 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  27.09 
 
 		 369 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  24.85 
 
 		 745 aa  96.7  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2202  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  33 
 
 		 332 aa  97.1  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  28.25 
 
 		 341 aa  95.9  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  27.16 
 
 		 370 aa  92.4  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  25.55 
 
 		 367 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0484  polysaccharide pyruvyl transferase  31.27 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  27.36 
 
 		 1225 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3792  response regulator receiver domain-containing protein  26.05 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1683  polysaccharide pyruvyl transferase  22.78 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.167545  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1309  polysaccharide pyruvyl transferase  29.27 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2362  polysaccharide pyruvyl transferase  30.29 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0735051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0200  polysaccharide pyruvyl transferase  31.68 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.666339 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  25.97 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  24.26 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  25.99 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0247  polysaccharide pyruvyl transferase  32.73 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  26.38 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  25.14 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0249  polysaccharide pyruvyl transferase  32.73 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0990  polysaccharide pyruvyl transferase  24.58 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  26.24 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  26.64 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1801  hypothetical protein  22.77 
 
 		 368 aa  52.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0373  hypothetical protein  25.69 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0482859  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  20.78 
 
 		 438 aa  49.7  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0431  hypothetical protein  25.38 
 
 		 413 aa  49.7  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.645976  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1193  putative polysaccharide pyruvyl transferase  22.79 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0147  hypothetical protein  22.44 
 
 		 355 aa  43.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>