94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3108 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 
377 aa  766    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  46.43 
 
 
367 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  43.84 
 
 
388 aa  301  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  44.81 
 
 
366 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  38.77 
 
 
373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  39.78 
 
 
356 aa  271  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  42.13 
 
 
367 aa  269  7e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  41.55 
 
 
367 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  41.55 
 
 
367 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  41.55 
 
 
367 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  40.72 
 
 
367 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  40.64 
 
 
369 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  37.91 
 
 
745 aa  259  8e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  41.39 
 
 
362 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  41.11 
 
 
362 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  39.07 
 
 
375 aa  255  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  41.39 
 
 
362 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  41.01 
 
 
369 aa  242  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  40.44 
 
 
367 aa  236  6e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  35.36 
 
 
745 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  36.54 
 
 
612 aa  216  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  34.32 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  36.28 
 
 
370 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  36.01 
 
 
348 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  36.01 
 
 
348 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1529  hypothetical protein  31.04 
 
 
339 aa  143  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2747  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  32.8 
 
 
348 aa  136  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4433  polysaccharide pyruvyl transferase  32.89 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3375  polysaccharide pyruvyl transferase  33.23 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1755  polysaccharide pyruvyl transferase  31.07 
 
 
347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  28.43 
 
 
395 aa  130  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  31.85 
 
 
378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  32.74 
 
 
383 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  30.16 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  31.54 
 
 
382 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2202  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  30.99 
 
 
332 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  24.11 
 
 
438 aa  113  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0200  polysaccharide pyruvyl transferase  33.43 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.666339 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0484  polysaccharide pyruvyl transferase  32.59 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  25.87 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2362  polysaccharide pyruvyl transferase  30.99 
 
 
332 aa  106  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0735051  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  25.58 
 
 
1225 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4479  polysaccharide pyruvyl transferase  29.56 
 
 
351 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15321  hypothetical protein  32.24 
 
 
367 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1476  hypothetical protein  30.56 
 
 
374 aa  101  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.470406  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1425  hypothetical protein  28.69 
 
 
360 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1309  polysaccharide pyruvyl transferase  27.02 
 
 
320 aa  97.8  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1074  hypothetical protein  30.84 
 
 
351 aa  96.3  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  27.41 
 
 
428 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0990  polysaccharide pyruvyl transferase  23.89 
 
 
336 aa  84  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0247  polysaccharide pyruvyl transferase  33.56 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0249  polysaccharide pyruvyl transferase  33.56 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1193  putative polysaccharide pyruvyl transferase  25 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1683  polysaccharide pyruvyl transferase  30.61 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.167545  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2327  putative pyruvyl transferase  24.72 
 
 
426 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244725  normal  0.210218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2334  putative pyruvyl transferase  24.44 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.703418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2226  putative pyruvyl transferase  24.44 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0937494  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2441  putative pyruvyl transferase  24.81 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2283  putative pyruvyl transferase  24.44 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193394 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  26.07 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0618  hypothetical protein  21.33 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  normal  0.0191891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  21.77 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  25.83 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1187  putative pyruvyl transferase  23.18 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0586  polysaccharide pyruvyl transferase  25.62 
 
 
395 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00188852  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0419  hypothetical protein  20.7 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01951  predicted pyruvyl transferase  22.84 
 
 
426 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01940  hypothetical protein  22.84 
 
 
426 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0157145  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  26.34 
 
 
430 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1612  polysaccharide pyruvyl transferase  22.84 
 
 
426 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00148194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2337  putative pyruvyl transferase  22.84 
 
 
426 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00581258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2979  putative pyruvyl transferase  22.84 
 
 
426 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.158831  hitchhiker  0.000214392 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1017  putative pyruvyl transferase  22.84 
 
 
426 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1596  putative pyruvyl transferase  22.84 
 
 
426 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0373  hypothetical protein  22.39 
 
 
413 aa  63.9  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0482859  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  22.67 
 
 
408 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0431  hypothetical protein  21.89 
 
 
413 aa  60.8  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.645976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1056  hypothetical protein  22.9 
 
 
408 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4482  hypothetical protein  26.11 
 
 
432 aa  57.4  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  23.92 
 
 
435 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2576  polysaccharide pyruvyl transferase  25.82 
 
 
406 aa  56.6  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2020  polysaccharide pyruvyl transferase  23.55 
 
 
392 aa  56.6  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0147  hypothetical protein  24.29 
 
 
355 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1238  hypothetical protein  22.69 
 
 
509 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.235902  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3929  hypothetical protein  21.99 
 
 
431 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  23.14 
 
 
367 aa  52.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4136  polysaccharide pyruvyl transferase  25.68 
 
 
394 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.920771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3539  polysaccharide pyruvyl transferase  23.26 
 
 
428 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1801  hypothetical protein  21.94 
 
 
368 aa  49.7  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1545  hypothetical protein  24.61 
 
 
385 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5589  glycosyl transferase family 9  31.36 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  25.52 
 
 
361 aa  46.6  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6752  polysaccharide pyruvyl transferase  23.53 
 
 
433 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.677486  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  31.31 
 
 
367 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>