48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0431 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0431  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  843    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.645976  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0373  hypothetical protein  99.52 
 
 
413 aa  839    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0482859  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  59.9 
 
 
408 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1056  hypothetical protein  37.82 
 
 
408 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  23.71 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  25.25 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  23 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  23.24 
 
 
400 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  23.27 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  20.4 
 
 
612 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  25.22 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  23.71 
 
 
430 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  25.44 
 
 
388 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  20.87 
 
 
367 aa  63.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  21.89 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  23.1 
 
 
366 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  19.75 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  19.75 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  19.75 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  19.75 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  24.93 
 
 
383 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  19.49 
 
 
367 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  24.2 
 
 
431 aa  57  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  25.69 
 
 
367 aa  57  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  19.83 
 
 
362 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  20.51 
 
 
369 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  19.53 
 
 
362 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  19.83 
 
 
375 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  22.65 
 
 
428 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  19.74 
 
 
745 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1425  hypothetical protein  24.49 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  22.58 
 
 
362 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4907  polysaccharide pyruvyl transferase  28.74 
 
 
332 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  22.03 
 
 
348 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  22.03 
 
 
348 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0586  polysaccharide pyruvyl transferase  24.47 
 
 
395 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00188852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  20.06 
 
 
369 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2327  putative pyruvyl transferase  20.84 
 
 
426 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244725  normal  0.210218 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0030  hypothetical protein  34.62 
 
 
347 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0361636 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2436  hypothetical protein  23.73 
 
 
399 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2226  putative pyruvyl transferase  20.58 
 
 
426 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0937494  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2334  putative pyruvyl transferase  20.58 
 
 
426 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.703418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  19.29 
 
 
435 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  18.99 
 
 
341 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2441  putative pyruvyl transferase  20.58 
 
 
426 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2283  putative pyruvyl transferase  20.84 
 
 
426 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193394 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  18.42 
 
 
426 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1074  hypothetical protein  25.23 
 
 
351 aa  43.9  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>