61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3356 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 
435 aa  889    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  25.51 
 
 
407 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2327  putative pyruvyl transferase  24.6 
 
 
426 aa  93.2  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244725  normal  0.210218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2441  putative pyruvyl transferase  24.37 
 
 
426 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2283  putative pyruvyl transferase  24.37 
 
 
426 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193394 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2226  putative pyruvyl transferase  24.37 
 
 
426 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0937494  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2334  putative pyruvyl transferase  24.37 
 
 
426 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.703418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1187  putative pyruvyl transferase  24.21 
 
 
426 aa  90.1  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01951  predicted pyruvyl transferase  23.53 
 
 
426 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01940  hypothetical protein  23.53 
 
 
426 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0157145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1596  putative pyruvyl transferase  23.98 
 
 
426 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1612  polysaccharide pyruvyl transferase  24.66 
 
 
426 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00148194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1017  putative pyruvyl transferase  23.98 
 
 
426 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2337  putative pyruvyl transferase  24.43 
 
 
426 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00581258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2979  putative pyruvyl transferase  24.66 
 
 
426 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.158831  hitchhiker  0.000214392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  27.43 
 
 
428 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  24.44 
 
 
426 aa  80.9  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  23.03 
 
 
431 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0960  polysaccharide pyruvyl transferase  22.26 
 
 
418 aa  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  22.66 
 
 
430 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0419  hypothetical protein  23.77 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4482  hypothetical protein  26.69 
 
 
432 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  24.01 
 
 
369 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0586  polysaccharide pyruvyl transferase  21.71 
 
 
395 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00188852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  22.76 
 
 
373 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0618  hypothetical protein  23.48 
 
 
405 aa  63.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  normal  0.0191891 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2020  polysaccharide pyruvyl transferase  22.68 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2868  hypothetical protein  23.86 
 
 
410 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  23.49 
 
 
369 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  24.47 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  24.47 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  24.75 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0829  polysaccharide pyruvyl transferase  23.17 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270983  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  24.47 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3842  hypothetical protein  24.43 
 
 
370 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  24.47 
 
 
367 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  22.3 
 
 
375 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  24.47 
 
 
367 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  23.92 
 
 
377 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  22.89 
 
 
388 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4136  polysaccharide pyruvyl transferase  22.85 
 
 
394 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.920771 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  22.26 
 
 
400 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  22.11 
 
 
367 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  20.29 
 
 
370 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  23.31 
 
 
362 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  20.78 
 
 
408 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  22.41 
 
 
362 aa  53.5  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  24.43 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  19.1 
 
 
438 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  22.07 
 
 
383 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1056  hypothetical protein  24.45 
 
 
408 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  21.04 
 
 
362 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  21.87 
 
 
356 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  32.65 
 
 
348 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  32.65 
 
 
348 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3792  response regulator receiver domain-containing protein  29.47 
 
 
359 aa  46.6  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  21.14 
 
 
612 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0990  polysaccharide pyruvyl transferase  31.43 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0030  hypothetical protein  22.87 
 
 
347 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0361636 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0431  hypothetical protein  19.29 
 
 
413 aa  45.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.645976  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  21.43 
 
 
745 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>