43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1056 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1056  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  847    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0431  hypothetical protein  37.56 
 
 		 413 aa  266  4e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.645976  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0373  hypothetical protein  37.63 
 
 		 413 aa  263  3e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0482859  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  35.77 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  26.28 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  25.4 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  25.37 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  24.02 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  23.12 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  26.97 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  21.52 
 
 		 745 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  22.81 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  25.15 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  23.81 
 
 		 375 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0764  hypothetical protein  25.81 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  22.81 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  25.37 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  23.38 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  20.85 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  20.85 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  20.85 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  25.57 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2747  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  21.61 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  23.71 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  20.6 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  20.88 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  20.84 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  22.59 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  22.36 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  25.94 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  20.52 
 
 		 745 aa  53.5  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  21.55 
 
 		 367 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  19.24 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  22.16 
 
 		 348 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  22.16 
 
 		 348 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  21.7 
 
 		 369 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  23.78 
 
 		 431 aa  49.7  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2436  hypothetical protein  26.14 
 
 		 399 aa  49.7  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  23.26 
 
 		 388 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4433  polysaccharide pyruvyl transferase  28.71 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  22.19 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  22.2 
 
 		 407 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4907  polysaccharide pyruvyl transferase  22.57 
 
 		 332 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>