63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3605 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  95.54 
 
 
382 aa  693    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 
382 aa  756    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  66.38 
 
 
383 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  64.58 
 
 
378 aa  430  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1476  hypothetical protein  45.21 
 
 
374 aa  255  9e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.470406  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  28.53 
 
 
612 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  34.69 
 
 
367 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  31.82 
 
 
356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  31.54 
 
 
377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  35.11 
 
 
388 aa  137  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  26.72 
 
 
367 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  26.19 
 
 
367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  26.72 
 
 
367 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  26.46 
 
 
367 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  26.46 
 
 
367 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  26.25 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  27.87 
 
 
745 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  26.29 
 
 
745 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  32.11 
 
 
366 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  29.97 
 
 
395 aa  119  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  25.26 
 
 
369 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  27.49 
 
 
375 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  26.72 
 
 
373 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  31.25 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  29.19 
 
 
400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  25.74 
 
 
362 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  25.98 
 
 
362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  25.44 
 
 
362 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  29.61 
 
 
367 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2747  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  28.77 
 
 
348 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  20.05 
 
 
438 aa  97.4  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  30.23 
 
 
348 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  30.23 
 
 
348 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4433  polysaccharide pyruvyl transferase  29.3 
 
 
350 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3375  polysaccharide pyruvyl transferase  28.8 
 
 
348 aa  92.8  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1755  polysaccharide pyruvyl transferase  27.37 
 
 
347 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1529  hypothetical protein  29.13 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032024 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1425  hypothetical protein  25.91 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1074  hypothetical protein  26.38 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  32.2 
 
 
1225 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1056  hypothetical protein  25.37 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  26.67 
 
 
428 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2202  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  26.93 
 
 
332 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  30.56 
 
 
430 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15321  hypothetical protein  27.07 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4479  polysaccharide pyruvyl transferase  27.61 
 
 
351 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  23.28 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  28.77 
 
 
431 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3792  response regulator receiver domain-containing protein  23.03 
 
 
359 aa  57.4  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  21.3 
 
 
407 aa  56.6  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0373  hypothetical protein  25 
 
 
413 aa  56.2  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0482859  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2362  polysaccharide pyruvyl transferase  27.22 
 
 
332 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0735051  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0419  hypothetical protein  25.28 
 
 
413 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0431  hypothetical protein  24.71 
 
 
413 aa  53.5  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.645976  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0618  hypothetical protein  20.22 
 
 
405 aa  50.4  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  normal  0.0191891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2226  putative pyruvyl transferase  22.37 
 
 
426 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0937494  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2334  putative pyruvyl transferase  22.37 
 
 
426 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.703418 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0200  polysaccharide pyruvyl transferase  29.19 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.666339 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  24.1 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2327  putative pyruvyl transferase  22.25 
 
 
426 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244725  normal  0.210218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2283  putative pyruvyl transferase  21.79 
 
 
426 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193394 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2441  putative pyruvyl transferase  22.07 
 
 
426 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248643 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0960  polysaccharide pyruvyl transferase  20.3 
 
 
418 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>