68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0956 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 		 407 aa  818    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  32.23 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  30.04 
 
 		 431 aa  142  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  28.17 
 
 		 745 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  28.49 
 
 		 373 aa  126  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0960  polysaccharide pyruvyl transferase  26.86 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  25.81 
 
 		 435 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  25.25 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0829  polysaccharide pyruvyl transferase  25.55 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270983  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  27.11 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  26.37 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0824  hypothetical protein  26.06 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00269709  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2283  putative pyruvyl transferase  25.09 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193394 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2226  putative pyruvyl transferase  25.09 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0937494  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2334  putative pyruvyl transferase  25.09 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.703418 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0586  polysaccharide pyruvyl transferase  26.8 
 
 		 395 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00188852  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2327  putative pyruvyl transferase  24.73 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244725  normal  0.210218 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  27.27 
 
 		 612 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2441  putative pyruvyl transferase  24.73 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248643 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4482  hypothetical protein  28.37 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  26.36 
 
 		 745 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  24.22 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  22.39 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0419  hypothetical protein  22.14 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  26.07 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  23.76 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1476  hypothetical protein  23.57 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.470406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  22.01 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0618  hypothetical protein  23.74 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  normal  0.0191891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01951  predicted pyruvyl transferase  21.68 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01940  hypothetical protein  21.68 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0157145  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  25.62 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1596  putative pyruvyl transferase  21.33 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2337  putative pyruvyl transferase  21.33 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00581258  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1017  putative pyruvyl transferase  21.33 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1187  putative pyruvyl transferase  21.33 
 
 		 426 aa  69.7  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1612  polysaccharide pyruvyl transferase  21.33 
 
 		 426 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00148194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2979  putative pyruvyl transferase  20.98 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.158831  hitchhiker  0.000214392 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2020  polysaccharide pyruvyl transferase  26.55 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  23.82 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  25.7 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  19.5 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  21.15 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  24.73 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  24.92 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  24.92 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  24.92 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  22.22 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  22.94 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  22.51 
 
 		 367 aa  57  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  24.59 
 
 		 367 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  26.86 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  25 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  23.26 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  22.96 
 
 		 382 aa  53.9  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2747  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  22.79 
 
 		 348 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  24 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4136  polysaccharide pyruvyl transferase  23.57 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.920771 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  23.16 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3929  hypothetical protein  24.11 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4479  polysaccharide pyruvyl transferase  21.19 
 
 		 351 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1193  putative polysaccharide pyruvyl transferase  23.17 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0729  hypothetical protein  25.76 
 
 		 443 aa  47.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  23.31 
 
 		 375 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  21.07 
 
 		 341 aa  47.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  24.63 
 
 		 362 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1056  hypothetical protein  21.81 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08701  hypothetical protein  26.28 
 
 		 284 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.583595  unclonable  0.0000000711364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>