47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4136 on replicon NC_009958
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009958  Dshi_4136  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 		 394 aa  796    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.920771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2020  polysaccharide pyruvyl transferase  43.56 
 
 		 392 aa  317  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  35.29 
 
 		 367 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0586  polysaccharide pyruvyl transferase  30.95 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00188852  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4482  hypothetical protein  31.97 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0960  polysaccharide pyruvyl transferase  27.57 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  28.62 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0829  polysaccharide pyruvyl transferase  29.46 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270983  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  26.84 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2981  hypothetical protein  24.58 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  28.09 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  27.01 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  24.52 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  23.69 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  26.25 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  23.24 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3539  polysaccharide pyruvyl transferase  26.19 
 
 		 428 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  23.22 
 
 		 356 aa  53.5  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  21.96 
 
 		 375 aa  50.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  20.36 
 
 		 369 aa  49.7  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  19.52 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  19.52 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  22.53 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1193  putative polysaccharide pyruvyl transferase  28.87 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  19.91 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0431  hypothetical protein  23.19 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.645976  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0373  hypothetical protein  23.19 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0482859  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6752  polysaccharide pyruvyl transferase  32.95 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.677486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  19.05 
 
 		 367 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  25.47 
 
 		 367 aa  47  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  19.05 
 
 		 367 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  19.05 
 
 		 367 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  20.81 
 
 		 362 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  25.62 
 
 		 395 aa  46.6  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  21.86 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0419  hypothetical protein  24.21 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2576  polysaccharide pyruvyl transferase  28.85 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2441  putative pyruvyl transferase  21.56 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248643 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  20.36 
 
 		 362 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2283  putative pyruvyl transferase  21.56 
 
 		 426 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193394 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  20.49 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  30.91 
 
 		 388 aa  43.5  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01940  hypothetical protein  20.79 
 
 		 426 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0157145  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01951  predicted pyruvyl transferase  20.79 
 
 		 426 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2334  putative pyruvyl transferase  21.9 
 
 		 426 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.703418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2226  putative pyruvyl transferase  21.9 
 
 		 426 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0937494  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  29.69 
 
 		 2845 aa  43.1  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>