45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0419 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0419  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  842    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0618  hypothetical protein  45.32 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  normal  0.0191891 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  25.13 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  19.44 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  22.14 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  23.5 
 
 		 745 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  20.7 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  19.71 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  23.77 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  23.62 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  26.21 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  22.93 
 
 		 745 aa  59.7  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  20.6 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  23.85 
 
 		 426 aa  57  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1476  hypothetical protein  26.72 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.470406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  22.61 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2283  putative pyruvyl transferase  24.64 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193394 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2334  putative pyruvyl transferase  24.64 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.703418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2226  putative pyruvyl transferase  24.64 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0937494  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2441  putative pyruvyl transferase  23.91 
 
 		 426 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2327  putative pyruvyl transferase  24.28 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244725  normal  0.210218 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  20 
 
 		 375 aa  53.5  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  19.65 
 
 		 367 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  18.89 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  18.39 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  18.39 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  19.4 
 
 		 367 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  22.87 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  23.64 
 
 		 431 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  18.8 
 
 		 362 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  19.14 
 
 		 369 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  21.45 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  19.43 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  24.24 
 
 		 383 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  27.51 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  25.71 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  18.52 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  26.75 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01940  hypothetical protein  22.42 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0157145  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2576  polysaccharide pyruvyl transferase  23.79 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01951  predicted pyruvyl transferase  22.42 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0960  polysaccharide pyruvyl transferase  22.19 
 
 		 418 aa  43.5  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1017  putative pyruvyl transferase  22.17 
 
 		 426 aa  43.1  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2337  putative pyruvyl transferase  22.17 
 
 		 426 aa  43.1  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00581258  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1193  putative polysaccharide pyruvyl transferase  33.33 
 
 		 387 aa  42.7  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>