34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2576 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2576  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 		 406 aa  819    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3539  polysaccharide pyruvyl transferase  39.15 
 
 		 428 aa  253  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6752  polysaccharide pyruvyl transferase  34.04 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.677486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1193  putative polysaccharide pyruvyl transferase  35.23 
 
 		 387 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  24.43 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  22.22 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  22.97 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  24.14 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  24.14 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  24.14 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  24.14 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  26.74 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  21.87 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  23.53 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  22.83 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  24.1 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  27.27 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  25.82 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  30.43 
 
 		 400 aa  53.5  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1476  hypothetical protein  29.29 
 
 		 374 aa  50.8  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.470406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  22.18 
 
 		 438 aa  50.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  28 
 
 		 367 aa  50.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.1 
 
 		 745 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  28.57 
 
 		 745 aa  47.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0618  hypothetical protein  21.86 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  normal  0.0191891 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2981  hypothetical protein  36.84 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4479  polysaccharide pyruvyl transferase  25.08 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3929  hypothetical protein  23.43 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0729  hypothetical protein  24.16 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0419  hypothetical protein  23.79 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4136  polysaccharide pyruvyl transferase  28.85 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.920771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  24.71 
 
 		 383 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  22.69 
 
 		 1225 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  38 
 
 		 341 aa  43.1  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>