17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2981 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2981  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  806    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  26.21 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4136  polysaccharide pyruvyl transferase  24.23 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.920771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4482  hypothetical protein  22.82 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  25.76 
 
 		 430 aa  57  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0586  polysaccharide pyruvyl transferase  20.61 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00188852  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  21.92 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  23.68 
 
 		 356 aa  53.5  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  23.33 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3929  hypothetical protein  22.2 
 
 		 431 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2020  polysaccharide pyruvyl transferase  22.96 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3842  hypothetical protein  21.37 
 
 		 370 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2576  polysaccharide pyruvyl transferase  36.84 
 
 		 406 aa  46.2  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  20 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23790  hypothetical protein  23.12 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2868  hypothetical protein  22.54 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  23.6 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>