87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2392 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 		 395 aa  805    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  32.17 
 
 		 373 aa  169  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2379  polysaccharide pyruvyl transferase  30.23 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000108064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  27.75 
 
 		 745 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3117  polysaccharide pyruvyl transferase  29.5 
 
 		 370 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.030522  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  30.33 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  32.25 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  31.76 
 
 		 366 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  28.43 
 
 		 377 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2062  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  28.73 
 
 		 612 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000046039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4122  polysaccharide pyruvyl transferase  31.37 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000169583  unclonable  0.000000000262551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3145  hypothetical protein  29.81 
 
 		 383 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.624247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2096  polysaccharide pyruvyl transferase  30.24 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  28.65 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4399  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  28.11 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0391258  hitchhiker  0.00000000000323458 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0932  pyruvyl-transferase  28.11 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.277719  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  28.82 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  27.51 
 
 		 367 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  28.07 
 
 		 367 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  28.07 
 
 		 367 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  28.07 
 
 		 367 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0783  polysaccharide pyruvyl transferase  29.12 
 
 		 362 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727732  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3364  polysaccharide pyruvyl transferase  29.87 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.324545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2271  polysaccharide pyruvyl transferase  28.61 
 
 		 378 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000535083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0786  pyruvyl-transferase  28.99 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3605  polysaccharide pyruvyl transferase  28.5 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.808806  hitchhiker  0.000648077 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  25.37 
 
 		 745 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  27.75 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4433  polysaccharide pyruvyl transferase  27.27 
 
 		 350 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1529  hypothetical protein  26.63 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0032024 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  23.95 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2747  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  27.91 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1476  hypothetical protein  26.75 
 
 		 374 aa  91.3  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.470406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  24.86 
 
 		 1225 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3375  polysaccharide pyruvyl transferase  26.69 
 
 		 348 aa  90.5  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1056  hypothetical protein  26.28 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  26.59 
 
 		 348 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  26.59 
 
 		 348 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0252  polysaccharide pyruvyl transferase  24.23 
 
 		 438 aa  86.7  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000318155  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3792  response regulator receiver domain-containing protein  24.32 
 
 		 359 aa  86.3  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1755  polysaccharide pyruvyl transferase  26.47 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0373  hypothetical protein  25.49 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0482859  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0431  hypothetical protein  25.25 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.645976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0419  hypothetical protein  25.13 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3253  putative polysaccharide pyruvyl transferase  24.67 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151053  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1425  hypothetical protein  26.76 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3383  polysaccharide pyruvyl transferase  21.84 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  25.62 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15321  hypothetical protein  24 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.29569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4479  polysaccharide pyruvyl transferase  25.84 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3962  hypothetical protein  22.81 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.259675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1074  hypothetical protein  25.42 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1801  hypothetical protein  22.77 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2607  hypothetical protein  23.28 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0001696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2576  polysaccharide pyruvyl transferase  24.1 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0147  hypothetical protein  23.85 
 
 		 355 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0484  polysaccharide pyruvyl transferase  25.83 
 
 		 336 aa  57  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  22.68 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1193  putative polysaccharide pyruvyl transferase  25.24 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0927448  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0200  polysaccharide pyruvyl transferase  23.72 
 
 		 323 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.666339 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2020  polysaccharide pyruvyl transferase  24.62 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  20.98 
 
 		 430 aa  53.1  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0618  hypothetical protein  22.07 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  normal  0.0191891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  22.42 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  21.62 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0960  polysaccharide pyruvyl transferase  21.67 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2283  putative pyruvyl transferase  20.2 
 
 		 426 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2202  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  23.53 
 
 		 332 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2226  putative pyruvyl transferase  19.95 
 
 		 426 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0937494  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2334  putative pyruvyl transferase  19.95 
 
 		 426 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.703418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2327  putative pyruvyl transferase  19.95 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244725  normal  0.210218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2217  hypothetical protein  21.45 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2362  polysaccharide pyruvyl transferase  25.97 
 
 		 332 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0735051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2441  putative pyruvyl transferase  19.75 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248643 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1309  polysaccharide pyruvyl transferase  25 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1187  putative pyruvyl transferase  23.44 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01951  predicted pyruvyl transferase  23.44 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01940  hypothetical protein  23.44 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0157145  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0247  polysaccharide pyruvyl transferase  24.86 
 
 		 316 aa  43.9  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1596  putative pyruvyl transferase  23.19 
 
 		 426 aa  43.5  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2337  putative pyruvyl transferase  22.92 
 
 		 426 aa  43.5  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00581258  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1017  putative pyruvyl transferase  23.19 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2979  putative pyruvyl transferase  23.19 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.158831  hitchhiker  0.000214392 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4136  polysaccharide pyruvyl transferase  24.27 
 
 		 394 aa  43.1  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.920771 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1612  polysaccharide pyruvyl transferase  23.19 
 
 		 426 aa  43.1  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00148194  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  22.86 
 
 		 367 aa  43.1  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0829  polysaccharide pyruvyl transferase  22.49 
 
 		 411 aa  42.7  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270983  normal  0.188909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>