53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2020 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2020  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 
392 aa  802    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4136  polysaccharide pyruvyl transferase  43.04 
 
 
394 aa  306  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.920771 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0586  polysaccharide pyruvyl transferase  32.8 
 
 
395 aa  149  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00188852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2943  polysaccharide pyruvyl transferase  30.79 
 
 
367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4482  hypothetical protein  27.44 
 
 
432 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0960  polysaccharide pyruvyl transferase  26.5 
 
 
418 aa  95.1  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0829  polysaccharide pyruvyl transferase  26.65 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270983  normal  0.188909 
 
 
-
 
NC_002936  DET0213  hypothetical protein  25.16 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0215  polysaccharide pyruvyl transferase  25.62 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0956  polysaccharide pyruvyl transferase  26.58 
 
 
407 aa  67  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2659  putative pyruvyl transferase  22.74 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520792  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0140  hypothetical protein  25.77 
 
 
430 aa  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.794718  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1129  polysaccharide pyruvyl transferase  25.11 
 
 
428 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.904656  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3356  polysaccharide pyruvyl transferase  22.68 
 
 
435 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1612  polysaccharide pyruvyl transferase  21.4 
 
 
426 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00148194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2337  putative pyruvyl transferase  20.73 
 
 
426 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00581258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1596  putative pyruvyl transferase  21.07 
 
 
426 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01951  predicted pyruvyl transferase  20.73 
 
 
426 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0168831  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01940  hypothetical protein  20.73 
 
 
426 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0157145  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1017  putative pyruvyl transferase  21.07 
 
 
426 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826012  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1187  putative pyruvyl transferase  20.73 
 
 
426 aa  57.4  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3108  polysaccharide pyruvyl transferase  23.55 
 
 
377 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00646313  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2979  putative pyruvyl transferase  21.07 
 
 
426 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.158831  hitchhiker  0.000214392 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2392  polysaccharide pyruvyl transferase  24.62 
 
 
395 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.692445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  22.73 
 
 
745 aa  54.3  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0123  polysaccharide pyruvyl transferase  27.09 
 
 
356 aa  53.1  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000678569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19370  hypothetical protein  20.42 
 
 
325 aa  53.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0713  polysaccharide pyruvyl transferase  22.01 
 
 
369 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.67475  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3539  polysaccharide pyruvyl transferase  37.5 
 
 
428 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4479  polysaccharide pyruvyl transferase  25.1 
 
 
351 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0972  CsaB protein  22.27 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953296  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  21.14 
 
 
745 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1408  polysaccharide pyruvyl transferase  22.17 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000381534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2981  hypothetical protein  22.96 
 
 
387 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0729  hypothetical protein  32.32 
 
 
443 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.741683  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2441  putative pyruvyl transferase  19.49 
 
 
426 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248643 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1063  CsaB protein  21.88 
 
 
367 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2226  putative pyruvyl transferase  19.58 
 
 
426 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0937494  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2283  putative pyruvyl transferase  19.49 
 
 
426 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193394 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2334  putative pyruvyl transferase  19.58 
 
 
426 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.703418 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1706  polysaccharide pyruvyl transferase  20.92 
 
 
348 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1731  polysaccharide pyruvyl transferase  20.92 
 
 
348 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16400  polysaccharide pyruvyl transferase  22.3 
 
 
373 aa  47  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229912  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2327  putative pyruvyl transferase  19.49 
 
 
426 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244725  normal  0.210218 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0788  pyruvyl-transferase  20.8 
 
 
367 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.192045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0884  pyruvyl-transferase  21.88 
 
 
367 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0840  CsaB protein  21.88 
 
 
367 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0973  CsaB protein  21.88 
 
 
367 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0112574 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0618  hypothetical protein  28.72 
 
 
405 aa  46.6  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  normal  0.0191891 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1529  hypothetical protein  22.61 
 
 
339 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4433  polysaccharide pyruvyl transferase  23.72 
 
 
350 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0102  polysaccharide pyruvyl transferase CsaB  24.27 
 
 
367 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4212  hypothetical protein  23.42 
 
 
289 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>